Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usb1Q91W78 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usb1Q91W78 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Usb1Q91W78 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Usb1Q91W78 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Usb1Q91W78 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usb1Q91W78 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usb1Q91W78 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Usb1Q91W78 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usb1Q91W78 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usb1Q91W78 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usb1Q91W78 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usb1Q91W78 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usb1Q91W78 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usb1Q91W78 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usb1Q91W78 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usb1Q91W78 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usb1Q91W78 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usb1Q91W78 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usb1Q91W78 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usb1Q91W78 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usb1Q91W78 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usb1Q91W78 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usb1Q91W78 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usb1Q91W78 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usb1Q91W78 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usb1Q91W78 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usb1Q91W78 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usb1Q91W78 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usb1Q91W78 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usb1Q91W78 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usb1Q91W78 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usb1Q91W78 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usb1Q91W78 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usb1Q91W78 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usb1Q91W78 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Usb1Q91W78 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Usb1Q91W78 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Usb1Q91W78 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Usb1Q91W78 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Usb1Q91W78 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usb1Q91W78 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usb1Q91W78 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usb1Q91W78 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usb1Q91W78 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usb1Q91W78 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usb1Q91W78 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usb1Q91W78 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usb1Q91W78 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usb1Q91W78 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usb1Q91W78 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usb1Q91W78 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Usb1Q91W78 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usb1Q91W78 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usb1Q91W78 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usb1Q91W78 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usb1Q91W78 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usb1Q91W78 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usb1Q91W78 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usb1Q91W78 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usb1Q91W78 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usb1Q91W78 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usb1Q91W78 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usb1Q91W78 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usb1Q91W78 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usb1Q91W78 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usb1Q91W78 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usb1Q91W78 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usb1Q91W78 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usb1Q91W78 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usb1Q91W78 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usb1Q91W78 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usb1Q91W78 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usb1Q91W78 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usb1Q91W78 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usb1Q91W78 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usb1Q91W78 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usb1Q91W78 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usb1Q91W78 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usb1Q91W78 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usb1Q91W78 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usb1Q91W78 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usb1Q91W78 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usb1Q91W78 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usb1Q91W78 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usb1Q91W78 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usb1Q91W78 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usb1Q91W78 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usb1Q91W78 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usb1Q91W78 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usb1Q91W78 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
Usb1Q91W78 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usb1Q91W78 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usb1Q91W78 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usb1Q91W78 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usb1Q91W78 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usb1Q91W78 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usb1Q91W78 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usb1Q91W78 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usb1Q91W78 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms