Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp3Q91W36 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp3Q91W36 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp3Q91W36 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp3Q91W36 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp3Q91W36 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Usp3Q91W36 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Usp3Q91W36 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp3Q91W36 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp3Q91W36 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp3Q91W36 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp3Q91W36 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp3Q91W36 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp3Q91W36 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp3Q91W36 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp3Q91W36 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp3Q91W36 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp3Q91W36 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp3Q91W36 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp3Q91W36 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp3Q91W36 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp3Q91W36 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp3Q91W36 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp3Q91W36 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp3Q91W36 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp3Q91W36 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp3Q91W36 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp3Q91W36 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp3Q91W36 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp3Q91W36 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp3Q91W36 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp3Q91W36 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp3Q91W36 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp3Q91W36 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp3Q91W36 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp3Q91W36 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp3Q91W36 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp3Q91W36 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp3Q91W36 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp3Q91W36 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp3Q91W36 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp3Q91W36 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp3Q91W36 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp3Q91W36 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp3Q91W36 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp3Q91W36 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp3Q91W36 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp3Q91W36 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp3Q91W36 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp3Q91W36 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp3Q91W36 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp3Q91W36 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp3Q91W36 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp3Q91W36 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp3Q91W36 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp3Q91W36 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp3Q91W36 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp3Q91W36 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp3Q91W36 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp3Q91W36 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp3Q91W36 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp3Q91W36 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp3Q91W36 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp3Q91W36 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp3Q91W36 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp3Q91W36 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp3Q91W36 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp3Q91W36 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp3Q91W36 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp3Q91W36 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp3Q91W36 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp3Q91W36 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp3Q91W36 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp3Q91W36 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp3Q91W36 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp3Q91W36 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp3Q91W36 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Usp3Q91W36 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Usp3Q91W36 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Usp3Q91W36 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Usp3Q91W36 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Usp3Q91W36 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Usp3Q91W36 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Usp3Q91W36 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Usp3Q91W36 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Usp3Q91W36 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp3Q91W36 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp3Q91W36 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp3Q91W36 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp3Q91W36 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp3Q91W36 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp3Q91W36 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp3Q91W36 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp3Q91W36 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp3Q91W36 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp3Q91W36 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp3Q91W36 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp3Q91W36 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp3Q91W36 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp3Q91W36 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms