Protein–RNA interactions for Protein: Q91VB4

Hps3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,002 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps3Q91VB4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hps3Q91VB4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hps3Q91VB4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hps3Q91VB4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hps3Q91VB4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hps3Q91VB4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hps3Q91VB4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hps3Q91VB4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hps3Q91VB4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hps3Q91VB4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hps3Q91VB4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hps3Q91VB4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hps3Q91VB4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hps3Q91VB4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hps3Q91VB4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hps3Q91VB4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hps3Q91VB4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hps3Q91VB4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hps3Q91VB4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hps3Q91VB4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Hps3Q91VB4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Hps3Q91VB4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hps3Q91VB4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hps3Q91VB4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hps3Q91VB4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Hps3Q91VB4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hps3Q91VB4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hps3Q91VB4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hps3Q91VB4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hps3Q91VB4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hps3Q91VB4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hps3Q91VB4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hps3Q91VB4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hps3Q91VB4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hps3Q91VB4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hps3Q91VB4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hps3Q91VB4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hps3Q91VB4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hps3Q91VB4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hps3Q91VB4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hps3Q91VB4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hps3Q91VB4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hps3Q91VB4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hps3Q91VB4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Hps3Q91VB4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Hps3Q91VB4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hps3Q91VB4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hps3Q91VB4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hps3Q91VB4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hps3Q91VB4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Hps3Q91VB4 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hps3Q91VB4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hps3Q91VB4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Hps3Q91VB4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hps3Q91VB4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hps3Q91VB4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hps3Q91VB4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hps3Q91VB4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hps3Q91VB4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hps3Q91VB4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Hps3Q91VB4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hps3Q91VB4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hps3Q91VB4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hps3Q91VB4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hps3Q91VB4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hps3Q91VB4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hps3Q91VB4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hps3Q91VB4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hps3Q91VB4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hps3Q91VB4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hps3Q91VB4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Hps3Q91VB4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hps3Q91VB4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hps3Q91VB4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hps3Q91VB4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hps3Q91VB4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Hps3Q91VB4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hps3Q91VB4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hps3Q91VB4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hps3Q91VB4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hps3Q91VB4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hps3Q91VB4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hps3Q91VB4 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hps3Q91VB4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hps3Q91VB4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hps3Q91VB4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hps3Q91VB4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Hps3Q91VB4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hps3Q91VB4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hps3Q91VB4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Hps3Q91VB4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hps3Q91VB4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hps3Q91VB4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hps3Q91VB4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hps3Q91VB4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hps3Q91VB4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hps3Q91VB4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hps3Q91VB4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hps3Q91VB4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hps3Q91VB4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131.1 ms