Protein–RNA interactions for Protein: Q91VA1

Slc44a4, Choline transporter-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a4Q91VA1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc44a4Q91VA1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc44a4Q91VA1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc44a4Q91VA1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc44a4Q91VA1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc44a4Q91VA1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc44a4Q91VA1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc44a4Q91VA1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc44a4Q91VA1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc44a4Q91VA1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc44a4Q91VA1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc44a4Q91VA1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc44a4Q91VA1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc44a4Q91VA1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc44a4Q91VA1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc44a4Q91VA1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc44a4Q91VA1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc44a4Q91VA1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc44a4Q91VA1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc44a4Q91VA1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc44a4Q91VA1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc44a4Q91VA1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc44a4Q91VA1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc44a4Q91VA1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Slc44a4Q91VA1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc44a4Q91VA1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc44a4Q91VA1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc44a4Q91VA1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc44a4Q91VA1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc44a4Q91VA1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc44a4Q91VA1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc44a4Q91VA1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc44a4Q91VA1 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc44a4Q91VA1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc44a4Q91VA1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc44a4Q91VA1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc44a4Q91VA1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc44a4Q91VA1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc44a4Q91VA1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc44a4Q91VA1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc44a4Q91VA1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc44a4Q91VA1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc44a4Q91VA1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc44a4Q91VA1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc44a4Q91VA1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc44a4Q91VA1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc44a4Q91VA1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc44a4Q91VA1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc44a4Q91VA1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc44a4Q91VA1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc44a4Q91VA1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc44a4Q91VA1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc44a4Q91VA1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc44a4Q91VA1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc44a4Q91VA1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc44a4Q91VA1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc44a4Q91VA1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc44a4Q91VA1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc44a4Q91VA1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc44a4Q91VA1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc44a4Q91VA1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc44a4Q91VA1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc44a4Q91VA1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc44a4Q91VA1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc44a4Q91VA1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc44a4Q91VA1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc44a4Q91VA1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc44a4Q91VA1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc44a4Q91VA1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc44a4Q91VA1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc44a4Q91VA1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc44a4Q91VA1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc44a4Q91VA1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc44a4Q91VA1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc44a4Q91VA1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc44a4Q91VA1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc44a4Q91VA1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc44a4Q91VA1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc44a4Q91VA1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc44a4Q91VA1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc44a4Q91VA1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc44a4Q91VA1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc44a4Q91VA1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc44a4Q91VA1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc44a4Q91VA1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc44a4Q91VA1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc44a4Q91VA1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc44a4Q91VA1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc44a4Q91VA1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc44a4Q91VA1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc44a4Q91VA1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc44a4Q91VA1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc44a4Q91VA1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc44a4Q91VA1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc44a4Q91VA1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Slc44a4Q91VA1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc44a4Q91VA1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc44a4Q91VA1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc44a4Q91VA1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc44a4Q91VA1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms