Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ppargc1bQ8VHJ7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ppargc1bQ8VHJ7 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ppargc1bQ8VHJ7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ppargc1bQ8VHJ7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ppargc1bQ8VHJ7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ppargc1bQ8VHJ7 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ppargc1bQ8VHJ7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 218.3 ms