Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc115Q8VE99 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc115Q8VE99 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc115Q8VE99 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc115Q8VE99 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc115Q8VE99 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc115Q8VE99 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc115Q8VE99 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc115Q8VE99 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc115Q8VE99 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc115Q8VE99 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc115Q8VE99 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc115Q8VE99 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc115Q8VE99 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc115Q8VE99 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc115Q8VE99 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc115Q8VE99 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc115Q8VE99 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ccdc115Q8VE99 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc115Q8VE99 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc115Q8VE99 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc115Q8VE99 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc115Q8VE99 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc115Q8VE99 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc115Q8VE99 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc115Q8VE99 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc115Q8VE99 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc115Q8VE99 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc115Q8VE99 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc115Q8VE99 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc115Q8VE99 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc115Q8VE99 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc115Q8VE99 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc115Q8VE99 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc115Q8VE99 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc115Q8VE99 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc115Q8VE99 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc115Q8VE99 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc115Q8VE99 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc115Q8VE99 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc115Q8VE99 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc115Q8VE99 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc115Q8VE99 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc115Q8VE99 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc115Q8VE99 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc115Q8VE99 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc115Q8VE99 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc115Q8VE99 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc115Q8VE99 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc115Q8VE99 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc115Q8VE99 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc115Q8VE99 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc115Q8VE99 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc115Q8VE99 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc115Q8VE99 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc115Q8VE99 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc115Q8VE99 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc115Q8VE99 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc115Q8VE99 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc115Q8VE99 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc115Q8VE99 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc115Q8VE99 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc115Q8VE99 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc115Q8VE99 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc115Q8VE99 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc115Q8VE99 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc115Q8VE99 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc115Q8VE99 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc115Q8VE99 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc115Q8VE99 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc115Q8VE99 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc115Q8VE99 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc115Q8VE99 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc115Q8VE99 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc115Q8VE99 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc115Q8VE99 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc115Q8VE99 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc115Q8VE99 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc115Q8VE99 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc115Q8VE99 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc115Q8VE99 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc115Q8VE99 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc115Q8VE99 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc115Q8VE99 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc115Q8VE99 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc115Q8VE99 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc115Q8VE99 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc115Q8VE99 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc115Q8VE99 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc115Q8VE99 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc115Q8VE99 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc115Q8VE99 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc115Q8VE99 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc115Q8VE99 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc115Q8VE99 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc115Q8VE99 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc115Q8VE99 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc115Q8VE99 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc115Q8VE99 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc115Q8VE99 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms