Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE73

Cul7, Cullin-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul7Q8VE73 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cul7Q8VE73 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cul7Q8VE73 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Cul7Q8VE73 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cul7Q8VE73 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cul7Q8VE73 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cul7Q8VE73 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cul7Q8VE73 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Cul7Q8VE73 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cul7Q8VE73 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cul7Q8VE73 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cul7Q8VE73 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cul7Q8VE73 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Cul7Q8VE73 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cul7Q8VE73 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cul7Q8VE73 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Cul7Q8VE73 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cul7Q8VE73 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cul7Q8VE73 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cul7Q8VE73 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cul7Q8VE73 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cul7Q8VE73 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cul7Q8VE73 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cul7Q8VE73 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cul7Q8VE73 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cul7Q8VE73 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Cul7Q8VE73 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cul7Q8VE73 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cul7Q8VE73 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Cul7Q8VE73 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Cul7Q8VE73 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cul7Q8VE73 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cul7Q8VE73 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cul7Q8VE73 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cul7Q8VE73 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cul7Q8VE73 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cul7Q8VE73 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cul7Q8VE73 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cul7Q8VE73 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Cul7Q8VE73 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cul7Q8VE73 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cul7Q8VE73 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cul7Q8VE73 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cul7Q8VE73 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cul7Q8VE73 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cul7Q8VE73 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cul7Q8VE73 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cul7Q8VE73 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cul7Q8VE73 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cul7Q8VE73 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Cul7Q8VE73 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Cul7Q8VE73 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cul7Q8VE73 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cul7Q8VE73 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cul7Q8VE73 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cul7Q8VE73 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cul7Q8VE73 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Cul7Q8VE73 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cul7Q8VE73 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Cul7Q8VE73 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cul7Q8VE73 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cul7Q8VE73 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cul7Q8VE73 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cul7Q8VE73 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cul7Q8VE73 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cul7Q8VE73 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cul7Q8VE73 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Cul7Q8VE73 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cul7Q8VE73 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cul7Q8VE73 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Cul7Q8VE73 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cul7Q8VE73 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cul7Q8VE73 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Cul7Q8VE73 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cul7Q8VE73 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cul7Q8VE73 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cul7Q8VE73 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cul7Q8VE73 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Cul7Q8VE73 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cul7Q8VE73 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cul7Q8VE73 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cul7Q8VE73 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cul7Q8VE73 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Cul7Q8VE73 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cul7Q8VE73 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cul7Q8VE73 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cul7Q8VE73 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Cul7Q8VE73 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cul7Q8VE73 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cul7Q8VE73 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cul7Q8VE73 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cul7Q8VE73 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cul7Q8VE73 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cul7Q8VE73 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cul7Q8VE73 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cul7Q8VE73 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cul7Q8VE73 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cul7Q8VE73 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cul7Q8VE73 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cul7Q8VE73 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms