Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc6a20aQ8VDB9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc6a20aQ8VDB9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc6a20aQ8VDB9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc6a20aQ8VDB9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc6a20aQ8VDB9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc6a20aQ8VDB9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc6a20aQ8VDB9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc6a20aQ8VDB9 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc6a20aQ8VDB9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc6a20aQ8VDB9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc6a20aQ8VDB9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc6a20aQ8VDB9 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc6a20aQ8VDB9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc6a20aQ8VDB9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc6a20aQ8VDB9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc6a20aQ8VDB9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc6a20aQ8VDB9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc6a20aQ8VDB9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc6a20aQ8VDB9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc6a20aQ8VDB9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc6a20aQ8VDB9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc6a20aQ8VDB9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc6a20aQ8VDB9 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc6a20aQ8VDB9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc6a20aQ8VDB9 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc6a20aQ8VDB9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc6a20aQ8VDB9 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc6a20aQ8VDB9 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc6a20aQ8VDB9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc6a20aQ8VDB9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc6a20aQ8VDB9 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc6a20aQ8VDB9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc6a20aQ8VDB9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc6a20aQ8VDB9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc6a20aQ8VDB9 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc6a20aQ8VDB9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc6a20aQ8VDB9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc6a20aQ8VDB9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc6a20aQ8VDB9 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc6a20aQ8VDB9 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc6a20aQ8VDB9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc6a20aQ8VDB9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc6a20aQ8VDB9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc6a20aQ8VDB9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc6a20aQ8VDB9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc6a20aQ8VDB9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc6a20aQ8VDB9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc6a20aQ8VDB9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc6a20aQ8VDB9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc6a20aQ8VDB9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc6a20aQ8VDB9 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc6a20aQ8VDB9 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc6a20aQ8VDB9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc6a20aQ8VDB9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc6a20aQ8VDB9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc6a20aQ8VDB9 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc6a20aQ8VDB9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc6a20aQ8VDB9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc6a20aQ8VDB9 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc6a20aQ8VDB9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc6a20aQ8VDB9 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc6a20aQ8VDB9 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc6a20aQ8VDB9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc6a20aQ8VDB9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc6a20aQ8VDB9 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc6a20aQ8VDB9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc6a20aQ8VDB9 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc6a20aQ8VDB9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc6a20aQ8VDB9 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc6a20aQ8VDB9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc6a20aQ8VDB9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc6a20aQ8VDB9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc6a20aQ8VDB9 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc6a20aQ8VDB9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc6a20aQ8VDB9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc6a20aQ8VDB9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc6a20aQ8VDB9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc6a20aQ8VDB9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc6a20aQ8VDB9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc6a20aQ8VDB9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc6a20aQ8VDB9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc6a20aQ8VDB9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc6a20aQ8VDB9 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc6a20aQ8VDB9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc6a20aQ8VDB9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc6a20aQ8VDB9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc6a20aQ8VDB9 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc6a20aQ8VDB9 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc6a20aQ8VDB9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc6a20aQ8VDB9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc6a20aQ8VDB9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc6a20aQ8VDB9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc6a20aQ8VDB9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc6a20aQ8VDB9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc6a20aQ8VDB9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc6a20aQ8VDB9 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc6a20aQ8VDB9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc6a20aQ8VDB9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms