Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBV3

Exosc2, Exosome complex component RRP4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc2Q8VBV3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Exosc2Q8VBV3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Exosc2Q8VBV3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Exosc2Q8VBV3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Exosc2Q8VBV3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Exosc2Q8VBV3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Exosc2Q8VBV3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Exosc2Q8VBV3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Exosc2Q8VBV3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Exosc2Q8VBV3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Exosc2Q8VBV3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Exosc2Q8VBV3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Exosc2Q8VBV3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Exosc2Q8VBV3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Exosc2Q8VBV3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Exosc2Q8VBV3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Exosc2Q8VBV3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Exosc2Q8VBV3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Exosc2Q8VBV3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Exosc2Q8VBV3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Exosc2Q8VBV3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Exosc2Q8VBV3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Exosc2Q8VBV3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Exosc2Q8VBV3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Exosc2Q8VBV3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Exosc2Q8VBV3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Exosc2Q8VBV3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Exosc2Q8VBV3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Exosc2Q8VBV3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Exosc2Q8VBV3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Exosc2Q8VBV3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Exosc2Q8VBV3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Exosc2Q8VBV3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Exosc2Q8VBV3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Exosc2Q8VBV3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Exosc2Q8VBV3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Exosc2Q8VBV3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Exosc2Q8VBV3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Exosc2Q8VBV3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Exosc2Q8VBV3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Exosc2Q8VBV3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Exosc2Q8VBV3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Exosc2Q8VBV3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Exosc2Q8VBV3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Exosc2Q8VBV3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exosc2Q8VBV3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exosc2Q8VBV3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exosc2Q8VBV3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exosc2Q8VBV3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exosc2Q8VBV3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exosc2Q8VBV3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exosc2Q8VBV3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exosc2Q8VBV3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exosc2Q8VBV3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exosc2Q8VBV3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exosc2Q8VBV3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exosc2Q8VBV3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exosc2Q8VBV3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Exosc2Q8VBV3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exosc2Q8VBV3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exosc2Q8VBV3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exosc2Q8VBV3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Exosc2Q8VBV3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Exosc2Q8VBV3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Exosc2Q8VBV3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Exosc2Q8VBV3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Exosc2Q8VBV3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Exosc2Q8VBV3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Exosc2Q8VBV3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Exosc2Q8VBV3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Exosc2Q8VBV3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Exosc2Q8VBV3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Exosc2Q8VBV3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Exosc2Q8VBV3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Exosc2Q8VBV3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Exosc2Q8VBV3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Exosc2Q8VBV3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Exosc2Q8VBV3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Exosc2Q8VBV3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Exosc2Q8VBV3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Exosc2Q8VBV3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Exosc2Q8VBV3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Exosc2Q8VBV3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Exosc2Q8VBV3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Exosc2Q8VBV3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Exosc2Q8VBV3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Exosc2Q8VBV3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Exosc2Q8VBV3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Exosc2Q8VBV3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exosc2Q8VBV3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exosc2Q8VBV3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exosc2Q8VBV3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exosc2Q8VBV3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exosc2Q8VBV3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exosc2Q8VBV3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exosc2Q8VBV3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exosc2Q8VBV3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exosc2Q8VBV3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exosc2Q8VBV3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exosc2Q8VBV3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms