Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT1

Txlnb, Beta-taxilin, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TxlnbQ8VBT1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TxlnbQ8VBT1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TxlnbQ8VBT1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TxlnbQ8VBT1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TxlnbQ8VBT1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TxlnbQ8VBT1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TxlnbQ8VBT1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TxlnbQ8VBT1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TxlnbQ8VBT1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TxlnbQ8VBT1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TxlnbQ8VBT1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TxlnbQ8VBT1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TxlnbQ8VBT1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TxlnbQ8VBT1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TxlnbQ8VBT1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TxlnbQ8VBT1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TxlnbQ8VBT1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TxlnbQ8VBT1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TxlnbQ8VBT1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TxlnbQ8VBT1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TxlnbQ8VBT1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TxlnbQ8VBT1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TxlnbQ8VBT1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TxlnbQ8VBT1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TxlnbQ8VBT1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TxlnbQ8VBT1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TxlnbQ8VBT1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TxlnbQ8VBT1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TxlnbQ8VBT1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TxlnbQ8VBT1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TxlnbQ8VBT1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TxlnbQ8VBT1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TxlnbQ8VBT1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TxlnbQ8VBT1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TxlnbQ8VBT1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TxlnbQ8VBT1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TxlnbQ8VBT1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TxlnbQ8VBT1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TxlnbQ8VBT1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TxlnbQ8VBT1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TxlnbQ8VBT1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TxlnbQ8VBT1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TxlnbQ8VBT1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TxlnbQ8VBT1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TxlnbQ8VBT1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TxlnbQ8VBT1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TxlnbQ8VBT1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TxlnbQ8VBT1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TxlnbQ8VBT1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TxlnbQ8VBT1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TxlnbQ8VBT1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TxlnbQ8VBT1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TxlnbQ8VBT1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TxlnbQ8VBT1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TxlnbQ8VBT1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TxlnbQ8VBT1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TxlnbQ8VBT1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TxlnbQ8VBT1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TxlnbQ8VBT1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TxlnbQ8VBT1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TxlnbQ8VBT1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TxlnbQ8VBT1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TxlnbQ8VBT1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TxlnbQ8VBT1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TxlnbQ8VBT1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TxlnbQ8VBT1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TxlnbQ8VBT1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TxlnbQ8VBT1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TxlnbQ8VBT1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TxlnbQ8VBT1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TxlnbQ8VBT1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TxlnbQ8VBT1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TxlnbQ8VBT1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TxlnbQ8VBT1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TxlnbQ8VBT1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TxlnbQ8VBT1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TxlnbQ8VBT1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TxlnbQ8VBT1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TxlnbQ8VBT1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TxlnbQ8VBT1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TxlnbQ8VBT1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TxlnbQ8VBT1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TxlnbQ8VBT1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TxlnbQ8VBT1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TxlnbQ8VBT1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TxlnbQ8VBT1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TxlnbQ8VBT1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TxlnbQ8VBT1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TxlnbQ8VBT1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TxlnbQ8VBT1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TxlnbQ8VBT1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TxlnbQ8VBT1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TxlnbQ8VBT1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TxlnbQ8VBT1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TxlnbQ8VBT1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TxlnbQ8VBT1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TxlnbQ8VBT1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TxlnbQ8VBT1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TxlnbQ8VBT1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TxlnbQ8VBT1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms