Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1mtQ8R4U6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Top1mtQ8R4U6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Top1mtQ8R4U6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Top1mtQ8R4U6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Top1mtQ8R4U6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Top1mtQ8R4U6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Top1mtQ8R4U6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Top1mtQ8R4U6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Top1mtQ8R4U6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Top1mtQ8R4U6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Top1mtQ8R4U6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Top1mtQ8R4U6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Top1mtQ8R4U6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Top1mtQ8R4U6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Top1mtQ8R4U6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Top1mtQ8R4U6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Top1mtQ8R4U6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Top1mtQ8R4U6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Top1mtQ8R4U6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Top1mtQ8R4U6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Top1mtQ8R4U6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Top1mtQ8R4U6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Top1mtQ8R4U6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Top1mtQ8R4U6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Top1mtQ8R4U6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Top1mtQ8R4U6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Top1mtQ8R4U6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Top1mtQ8R4U6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Top1mtQ8R4U6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Top1mtQ8R4U6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Top1mtQ8R4U6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Top1mtQ8R4U6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Top1mtQ8R4U6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Top1mtQ8R4U6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Top1mtQ8R4U6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Top1mtQ8R4U6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Top1mtQ8R4U6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Top1mtQ8R4U6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Top1mtQ8R4U6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Top1mtQ8R4U6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Top1mtQ8R4U6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Top1mtQ8R4U6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Top1mtQ8R4U6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Top1mtQ8R4U6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Top1mtQ8R4U6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Top1mtQ8R4U6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Top1mtQ8R4U6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Top1mtQ8R4U6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Top1mtQ8R4U6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Top1mtQ8R4U6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Top1mtQ8R4U6 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Top1mtQ8R4U6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Top1mtQ8R4U6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Top1mtQ8R4U6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Top1mtQ8R4U6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Top1mtQ8R4U6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Top1mtQ8R4U6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Top1mtQ8R4U6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Top1mtQ8R4U6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Top1mtQ8R4U6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Top1mtQ8R4U6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Top1mtQ8R4U6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
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Top1mtQ8R4U6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Top1mtQ8R4U6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Top1mtQ8R4U6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Top1mtQ8R4U6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
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Top1mtQ8R4U6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
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Top1mtQ8R4U6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Top1mtQ8R4U6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Top1mtQ8R4U6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Top1mtQ8R4U6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Top1mtQ8R4U6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Top1mtQ8R4U6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Top1mtQ8R4U6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Top1mtQ8R4U6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Top1mtQ8R4U6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Top1mtQ8R4U6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Top1mtQ8R4U6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Top1mtQ8R4U6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Top1mtQ8R4U6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Top1mtQ8R4U6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Top1mtQ8R4U6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Top1mtQ8R4U6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Top1mtQ8R4U6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Top1mtQ8R4U6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Top1mtQ8R4U6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Top1mtQ8R4U6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Top1mtQ8R4U6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Top1mtQ8R4U6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Top1mtQ8R4U6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Top1mtQ8R4U6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Top1mtQ8R4U6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Top1mtQ8R4U6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Top1mtQ8R4U6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Top1mtQ8R4U6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Top1mtQ8R4U6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Top1mtQ8R4U6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
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