Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc12Q8R344 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc12Q8R344 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc12Q8R344 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc12Q8R344 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc12Q8R344 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc12Q8R344 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc12Q8R344 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc12Q8R344 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc12Q8R344 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc12Q8R344 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc12Q8R344 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc12Q8R344 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc12Q8R344 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc12Q8R344 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc12Q8R344 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc12Q8R344 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc12Q8R344 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc12Q8R344 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc12Q8R344 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc12Q8R344 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc12Q8R344 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc12Q8R344 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc12Q8R344 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc12Q8R344 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc12Q8R344 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc12Q8R344 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc12Q8R344 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc12Q8R344 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc12Q8R344 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc12Q8R344 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc12Q8R344 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc12Q8R344 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc12Q8R344 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc12Q8R344 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc12Q8R344 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc12Q8R344 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc12Q8R344 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc12Q8R344 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc12Q8R344 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc12Q8R344 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc12Q8R344 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc12Q8R344 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc12Q8R344 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc12Q8R344 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc12Q8R344 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc12Q8R344 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc12Q8R344 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc12Q8R344 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc12Q8R344 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc12Q8R344 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc12Q8R344 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc12Q8R344 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc12Q8R344 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc12Q8R344 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc12Q8R344 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc12Q8R344 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc12Q8R344 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc12Q8R344 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc12Q8R344 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc12Q8R344 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc12Q8R344 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc12Q8R344 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc12Q8R344 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc12Q8R344 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc12Q8R344 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc12Q8R344 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc12Q8R344 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc12Q8R344 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc12Q8R344 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc12Q8R344 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc12Q8R344 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc12Q8R344 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc12Q8R344 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc12Q8R344 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc12Q8R344 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc12Q8R344 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc12Q8R344 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc12Q8R344 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc12Q8R344 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc12Q8R344 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc12Q8R344 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc12Q8R344 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc12Q8R344 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc12Q8R344 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc12Q8R344 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc12Q8R344 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc12Q8R344 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc12Q8R344 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc12Q8R344 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc12Q8R344 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc12Q8R344 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc12Q8R344 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc12Q8R344 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc12Q8R344 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc12Q8R344 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc12Q8R344 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc12Q8R344 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc12Q8R344 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc12Q8R344 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms