Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2T8

Gtf3c5, General transcription factor 3C polypeptide 5, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c5Q8R2T8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf3c5Q8R2T8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf3c5Q8R2T8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf3c5Q8R2T8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf3c5Q8R2T8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf3c5Q8R2T8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtf3c5Q8R2T8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtf3c5Q8R2T8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtf3c5Q8R2T8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtf3c5Q8R2T8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtf3c5Q8R2T8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtf3c5Q8R2T8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Gtf3c5Q8R2T8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtf3c5Q8R2T8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtf3c5Q8R2T8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtf3c5Q8R2T8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtf3c5Q8R2T8 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtf3c5Q8R2T8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtf3c5Q8R2T8 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtf3c5Q8R2T8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtf3c5Q8R2T8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtf3c5Q8R2T8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtf3c5Q8R2T8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtf3c5Q8R2T8 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf3c5Q8R2T8 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf3c5Q8R2T8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf3c5Q8R2T8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf3c5Q8R2T8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf3c5Q8R2T8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf3c5Q8R2T8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf3c5Q8R2T8 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf3c5Q8R2T8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf3c5Q8R2T8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf3c5Q8R2T8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf3c5Q8R2T8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf3c5Q8R2T8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf3c5Q8R2T8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf3c5Q8R2T8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf3c5Q8R2T8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf3c5Q8R2T8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf3c5Q8R2T8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf3c5Q8R2T8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf3c5Q8R2T8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf3c5Q8R2T8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf3c5Q8R2T8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf3c5Q8R2T8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf3c5Q8R2T8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf3c5Q8R2T8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf3c5Q8R2T8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf3c5Q8R2T8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtf3c5Q8R2T8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtf3c5Q8R2T8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtf3c5Q8R2T8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtf3c5Q8R2T8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtf3c5Q8R2T8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtf3c5Q8R2T8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtf3c5Q8R2T8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtf3c5Q8R2T8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtf3c5Q8R2T8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtf3c5Q8R2T8 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtf3c5Q8R2T8 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtf3c5Q8R2T8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtf3c5Q8R2T8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtf3c5Q8R2T8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtf3c5Q8R2T8 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtf3c5Q8R2T8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtf3c5Q8R2T8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtf3c5Q8R2T8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtf3c5Q8R2T8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtf3c5Q8R2T8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtf3c5Q8R2T8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtf3c5Q8R2T8 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtf3c5Q8R2T8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtf3c5Q8R2T8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtf3c5Q8R2T8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtf3c5Q8R2T8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gtf3c5Q8R2T8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gtf3c5Q8R2T8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gtf3c5Q8R2T8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Gtf3c5Q8R2T8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Gtf3c5Q8R2T8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gtf3c5Q8R2T8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gtf3c5Q8R2T8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gtf3c5Q8R2T8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Gtf3c5Q8R2T8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gtf3c5Q8R2T8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gtf3c5Q8R2T8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gtf3c5Q8R2T8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gtf3c5Q8R2T8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gtf3c5Q8R2T8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtf3c5Q8R2T8 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtf3c5Q8R2T8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtf3c5Q8R2T8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtf3c5Q8R2T8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtf3c5Q8R2T8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtf3c5Q8R2T8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtf3c5Q8R2T8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtf3c5Q8R2T8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtf3c5Q8R2T8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtf3c5Q8R2T8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms