Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Q0

Trim29, Tripartite motif-containing protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim29Q8R2Q0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim29Q8R2Q0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim29Q8R2Q0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim29Q8R2Q0 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim29Q8R2Q0 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim29Q8R2Q0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim29Q8R2Q0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim29Q8R2Q0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim29Q8R2Q0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim29Q8R2Q0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim29Q8R2Q0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim29Q8R2Q0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim29Q8R2Q0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim29Q8R2Q0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim29Q8R2Q0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim29Q8R2Q0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim29Q8R2Q0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim29Q8R2Q0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim29Q8R2Q0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Trim29Q8R2Q0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Trim29Q8R2Q0 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim29Q8R2Q0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim29Q8R2Q0 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim29Q8R2Q0 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim29Q8R2Q0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim29Q8R2Q0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim29Q8R2Q0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim29Q8R2Q0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim29Q8R2Q0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim29Q8R2Q0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim29Q8R2Q0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim29Q8R2Q0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim29Q8R2Q0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim29Q8R2Q0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim29Q8R2Q0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim29Q8R2Q0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim29Q8R2Q0 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim29Q8R2Q0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim29Q8R2Q0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim29Q8R2Q0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim29Q8R2Q0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim29Q8R2Q0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim29Q8R2Q0 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim29Q8R2Q0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim29Q8R2Q0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim29Q8R2Q0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim29Q8R2Q0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim29Q8R2Q0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim29Q8R2Q0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim29Q8R2Q0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim29Q8R2Q0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim29Q8R2Q0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim29Q8R2Q0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim29Q8R2Q0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim29Q8R2Q0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim29Q8R2Q0 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim29Q8R2Q0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim29Q8R2Q0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim29Q8R2Q0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim29Q8R2Q0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim29Q8R2Q0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim29Q8R2Q0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim29Q8R2Q0 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim29Q8R2Q0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim29Q8R2Q0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim29Q8R2Q0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim29Q8R2Q0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim29Q8R2Q0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim29Q8R2Q0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim29Q8R2Q0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim29Q8R2Q0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim29Q8R2Q0 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim29Q8R2Q0 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim29Q8R2Q0 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim29Q8R2Q0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim29Q8R2Q0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim29Q8R2Q0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim29Q8R2Q0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim29Q8R2Q0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim29Q8R2Q0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim29Q8R2Q0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim29Q8R2Q0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim29Q8R2Q0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim29Q8R2Q0 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim29Q8R2Q0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim29Q8R2Q0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim29Q8R2Q0 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim29Q8R2Q0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim29Q8R2Q0 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim29Q8R2Q0 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim29Q8R2Q0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim29Q8R2Q0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim29Q8R2Q0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim29Q8R2Q0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim29Q8R2Q0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim29Q8R2Q0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim29Q8R2Q0 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim29Q8R2Q0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim29Q8R2Q0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim29Q8R2Q0 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms