Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1P4

Atg10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg10Q8R1P4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg10Q8R1P4 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg10Q8R1P4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg10Q8R1P4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg10Q8R1P4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg10Q8R1P4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg10Q8R1P4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg10Q8R1P4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg10Q8R1P4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg10Q8R1P4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg10Q8R1P4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg10Q8R1P4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg10Q8R1P4 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg10Q8R1P4 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg10Q8R1P4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg10Q8R1P4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg10Q8R1P4 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg10Q8R1P4 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg10Q8R1P4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg10Q8R1P4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg10Q8R1P4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg10Q8R1P4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg10Q8R1P4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg10Q8R1P4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg10Q8R1P4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg10Q8R1P4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg10Q8R1P4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg10Q8R1P4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg10Q8R1P4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg10Q8R1P4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg10Q8R1P4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg10Q8R1P4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg10Q8R1P4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg10Q8R1P4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg10Q8R1P4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg10Q8R1P4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg10Q8R1P4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg10Q8R1P4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg10Q8R1P4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg10Q8R1P4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg10Q8R1P4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg10Q8R1P4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg10Q8R1P4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg10Q8R1P4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg10Q8R1P4 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg10Q8R1P4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg10Q8R1P4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg10Q8R1P4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg10Q8R1P4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg10Q8R1P4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Atg10Q8R1P4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Atg10Q8R1P4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg10Q8R1P4 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg10Q8R1P4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg10Q8R1P4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg10Q8R1P4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg10Q8R1P4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg10Q8R1P4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg10Q8R1P4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg10Q8R1P4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg10Q8R1P4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg10Q8R1P4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg10Q8R1P4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg10Q8R1P4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg10Q8R1P4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg10Q8R1P4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg10Q8R1P4 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg10Q8R1P4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg10Q8R1P4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg10Q8R1P4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atg10Q8R1P4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Atg10Q8R1P4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Atg10Q8R1P4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atg10Q8R1P4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atg10Q8R1P4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atg10Q8R1P4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg10Q8R1P4 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg10Q8R1P4 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg10Q8R1P4 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg10Q8R1P4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg10Q8R1P4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg10Q8R1P4 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg10Q8R1P4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg10Q8R1P4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg10Q8R1P4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg10Q8R1P4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg10Q8R1P4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg10Q8R1P4 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg10Q8R1P4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg10Q8R1P4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg10Q8R1P4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg10Q8R1P4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg10Q8R1P4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg10Q8R1P4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg10Q8R1P4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg10Q8R1P4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg10Q8R1P4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg10Q8R1P4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg10Q8R1P4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg10Q8R1P4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms