Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

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Length 190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf183Q8QZS5 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf183Q8QZS5 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf183Q8QZS5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf183Q8QZS5 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf183Q8QZS5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf183Q8QZS5 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf183Q8QZS5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf183Q8QZS5 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf183Q8QZS5 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf183Q8QZS5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf183Q8QZS5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf183Q8QZS5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf183Q8QZS5 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf183Q8QZS5 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf183Q8QZS5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf183Q8QZS5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf183Q8QZS5 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf183Q8QZS5 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf183Q8QZS5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf183Q8QZS5 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf183Q8QZS5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf183Q8QZS5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf183Q8QZS5 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf183Q8QZS5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf183Q8QZS5 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf183Q8QZS5 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf183Q8QZS5 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf183Q8QZS5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf183Q8QZS5 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf183Q8QZS5 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf183Q8QZS5 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf183Q8QZS5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf183Q8QZS5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf183Q8QZS5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf183Q8QZS5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf183Q8QZS5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf183Q8QZS5 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf183Q8QZS5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf183Q8QZS5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Rnf183Q8QZS5 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Rnf183Q8QZS5 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Rnf183Q8QZS5 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf183Q8QZS5 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf183Q8QZS5 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Rnf183Q8QZS5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rnf183Q8QZS5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf183Q8QZS5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf183Q8QZS5 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rnf183Q8QZS5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rnf183Q8QZS5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Rnf183Q8QZS5 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf183Q8QZS5 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf183Q8QZS5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf183Q8QZS5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf183Q8QZS5 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf183Q8QZS5 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf183Q8QZS5 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf183Q8QZS5 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf183Q8QZS5 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf183Q8QZS5 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf183Q8QZS5 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf183Q8QZS5 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf183Q8QZS5 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf183Q8QZS5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf183Q8QZS5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf183Q8QZS5 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf183Q8QZS5 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf183Q8QZS5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Rnf183Q8QZS5 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf183Q8QZS5 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Rnf183Q8QZS5 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf183Q8QZS5 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf183Q8QZS5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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