Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MyripQ8K3I4 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MyripQ8K3I4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MyripQ8K3I4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MyripQ8K3I4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MyripQ8K3I4 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MyripQ8K3I4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MyripQ8K3I4 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MyripQ8K3I4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MyripQ8K3I4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MyripQ8K3I4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MyripQ8K3I4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
MyripQ8K3I4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MyripQ8K3I4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
MyripQ8K3I4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MyripQ8K3I4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MyripQ8K3I4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MyripQ8K3I4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MyripQ8K3I4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MyripQ8K3I4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MyripQ8K3I4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MyripQ8K3I4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MyripQ8K3I4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MyripQ8K3I4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MyripQ8K3I4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MyripQ8K3I4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MyripQ8K3I4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MyripQ8K3I4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
MyripQ8K3I4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MyripQ8K3I4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MyripQ8K3I4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MyripQ8K3I4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MyripQ8K3I4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MyripQ8K3I4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MyripQ8K3I4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MyripQ8K3I4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MyripQ8K3I4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MyripQ8K3I4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MyripQ8K3I4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MyripQ8K3I4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MyripQ8K3I4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MyripQ8K3I4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MyripQ8K3I4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MyripQ8K3I4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MyripQ8K3I4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MyripQ8K3I4 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MyripQ8K3I4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MyripQ8K3I4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MyripQ8K3I4 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MyripQ8K3I4 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MyripQ8K3I4 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
MyripQ8K3I4 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MyripQ8K3I4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MyripQ8K3I4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MyripQ8K3I4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MyripQ8K3I4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MyripQ8K3I4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MyripQ8K3I4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MyripQ8K3I4 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
MyripQ8K3I4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MyripQ8K3I4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
MyripQ8K3I4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MyripQ8K3I4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MyripQ8K3I4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MyripQ8K3I4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MyripQ8K3I4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MyripQ8K3I4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MyripQ8K3I4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MyripQ8K3I4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MyripQ8K3I4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MyripQ8K3I4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
MyripQ8K3I4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MyripQ8K3I4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MyripQ8K3I4 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MyripQ8K3I4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MyripQ8K3I4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MyripQ8K3I4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MyripQ8K3I4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MyripQ8K3I4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
MyripQ8K3I4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MyripQ8K3I4 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MyripQ8K3I4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
MyripQ8K3I4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
MyripQ8K3I4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MyripQ8K3I4 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MyripQ8K3I4 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
MyripQ8K3I4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MyripQ8K3I4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MyripQ8K3I4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MyripQ8K3I4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MyripQ8K3I4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MyripQ8K3I4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MyripQ8K3I4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MyripQ8K3I4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MyripQ8K3I4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
MyripQ8K3I4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MyripQ8K3I4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MyripQ8K3I4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MyripQ8K3I4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
MyripQ8K3I4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms