Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3G5

Vrk3, Inactive serine/threonine-protein kinase VRK3, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vrk3Q8K3G5 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vrk3Q8K3G5 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vrk3Q8K3G5 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vrk3Q8K3G5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vrk3Q8K3G5 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vrk3Q8K3G5 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vrk3Q8K3G5 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vrk3Q8K3G5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Vrk3Q8K3G5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Vrk3Q8K3G5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vrk3Q8K3G5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vrk3Q8K3G5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vrk3Q8K3G5 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vrk3Q8K3G5 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vrk3Q8K3G5 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vrk3Q8K3G5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vrk3Q8K3G5 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vrk3Q8K3G5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vrk3Q8K3G5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vrk3Q8K3G5 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vrk3Q8K3G5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vrk3Q8K3G5 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vrk3Q8K3G5 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vrk3Q8K3G5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vrk3Q8K3G5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vrk3Q8K3G5 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vrk3Q8K3G5 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vrk3Q8K3G5 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vrk3Q8K3G5 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vrk3Q8K3G5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vrk3Q8K3G5 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vrk3Q8K3G5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vrk3Q8K3G5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vrk3Q8K3G5 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vrk3Q8K3G5 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Vrk3Q8K3G5 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vrk3Q8K3G5 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vrk3Q8K3G5 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vrk3Q8K3G5 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vrk3Q8K3G5 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Vrk3Q8K3G5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vrk3Q8K3G5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vrk3Q8K3G5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vrk3Q8K3G5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vrk3Q8K3G5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vrk3Q8K3G5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vrk3Q8K3G5 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vrk3Q8K3G5 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vrk3Q8K3G5 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vrk3Q8K3G5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vrk3Q8K3G5 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vrk3Q8K3G5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vrk3Q8K3G5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vrk3Q8K3G5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vrk3Q8K3G5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vrk3Q8K3G5 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vrk3Q8K3G5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vrk3Q8K3G5 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vrk3Q8K3G5 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vrk3Q8K3G5 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vrk3Q8K3G5 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vrk3Q8K3G5 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Vrk3Q8K3G5 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vrk3Q8K3G5 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vrk3Q8K3G5 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vrk3Q8K3G5 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vrk3Q8K3G5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vrk3Q8K3G5 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vrk3Q8K3G5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vrk3Q8K3G5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vrk3Q8K3G5 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Vrk3Q8K3G5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vrk3Q8K3G5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Vrk3Q8K3G5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vrk3Q8K3G5 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vrk3Q8K3G5 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vrk3Q8K3G5 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vrk3Q8K3G5 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vrk3Q8K3G5 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vrk3Q8K3G5 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vrk3Q8K3G5 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vrk3Q8K3G5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vrk3Q8K3G5 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vrk3Q8K3G5 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vrk3Q8K3G5 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vrk3Q8K3G5 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vrk3Q8K3G5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vrk3Q8K3G5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Vrk3Q8K3G5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vrk3Q8K3G5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vrk3Q8K3G5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vrk3Q8K3G5 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vrk3Q8K3G5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vrk3Q8K3G5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vrk3Q8K3G5 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vrk3Q8K3G5 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vrk3Q8K3G5 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vrk3Q8K3G5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vrk3Q8K3G5 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vrk3Q8K3G5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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