Protein–RNA interactions for Protein: Q8K389

Cdk5rap2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap2Q8K389 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cdk5rap2Q8K389 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Cdk5rap2Q8K389 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cdk5rap2Q8K389 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Cdk5rap2Q8K389 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cdk5rap2Q8K389 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cdk5rap2Q8K389 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cdk5rap2Q8K389 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cdk5rap2Q8K389 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cdk5rap2Q8K389 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cdk5rap2Q8K389 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cdk5rap2Q8K389 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cdk5rap2Q8K389 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cdk5rap2Q8K389 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cdk5rap2Q8K389 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cdk5rap2Q8K389 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cdk5rap2Q8K389 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cdk5rap2Q8K389 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Cdk5rap2Q8K389 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cdk5rap2Q8K389 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cdk5rap2Q8K389 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cdk5rap2Q8K389 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cdk5rap2Q8K389 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Cdk5rap2Q8K389 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cdk5rap2Q8K389 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cdk5rap2Q8K389 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cdk5rap2Q8K389 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cdk5rap2Q8K389 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Cdk5rap2Q8K389 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cdk5rap2Q8K389 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cdk5rap2Q8K389 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cdk5rap2Q8K389 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cdk5rap2Q8K389 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cdk5rap2Q8K389 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cdk5rap2Q8K389 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cdk5rap2Q8K389 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cdk5rap2Q8K389 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cdk5rap2Q8K389 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cdk5rap2Q8K389 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cdk5rap2Q8K389 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Cdk5rap2Q8K389 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cdk5rap2Q8K389 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Cdk5rap2Q8K389 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cdk5rap2Q8K389 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cdk5rap2Q8K389 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cdk5rap2Q8K389 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cdk5rap2Q8K389 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cdk5rap2Q8K389 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cdk5rap2Q8K389 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cdk5rap2Q8K389 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cdk5rap2Q8K389 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cdk5rap2Q8K389 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cdk5rap2Q8K389 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cdk5rap2Q8K389 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cdk5rap2Q8K389 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cdk5rap2Q8K389 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cdk5rap2Q8K389 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cdk5rap2Q8K389 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cdk5rap2Q8K389 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cdk5rap2Q8K389 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Cdk5rap2Q8K389 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cdk5rap2Q8K389 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cdk5rap2Q8K389 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cdk5rap2Q8K389 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cdk5rap2Q8K389 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cdk5rap2Q8K389 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cdk5rap2Q8K389 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cdk5rap2Q8K389 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cdk5rap2Q8K389 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cdk5rap2Q8K389 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cdk5rap2Q8K389 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cdk5rap2Q8K389 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cdk5rap2Q8K389 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cdk5rap2Q8K389 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cdk5rap2Q8K389 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cdk5rap2Q8K389 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cdk5rap2Q8K389 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cdk5rap2Q8K389 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cdk5rap2Q8K389 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cdk5rap2Q8K389 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cdk5rap2Q8K389 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cdk5rap2Q8K389 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cdk5rap2Q8K389 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cdk5rap2Q8K389 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cdk5rap2Q8K389 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cdk5rap2Q8K389 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Cdk5rap2Q8K389 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cdk5rap2Q8K389 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cdk5rap2Q8K389 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cdk5rap2Q8K389 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cdk5rap2Q8K389 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cdk5rap2Q8K389 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cdk5rap2Q8K389 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cdk5rap2Q8K389 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cdk5rap2Q8K389 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Cdk5rap2Q8K389 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cdk5rap2Q8K389 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Cdk5rap2Q8K389 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cdk5rap2Q8K389 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cdk5rap2Q8K389 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms