Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrtm1Q8K377 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrtm1Q8K377 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrtm1Q8K377 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrtm1Q8K377 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrtm1Q8K377 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrtm1Q8K377 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrtm1Q8K377 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrtm1Q8K377 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrtm1Q8K377 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrtm1Q8K377 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrtm1Q8K377 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrtm1Q8K377 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrtm1Q8K377 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrtm1Q8K377 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrtm1Q8K377 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrtm1Q8K377 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrtm1Q8K377 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrtm1Q8K377 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrtm1Q8K377 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrtm1Q8K377 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrtm1Q8K377 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrtm1Q8K377 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrtm1Q8K377 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrtm1Q8K377 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrtm1Q8K377 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrtm1Q8K377 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrtm1Q8K377 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrtm1Q8K377 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrtm1Q8K377 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrtm1Q8K377 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrtm1Q8K377 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrtm1Q8K377 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrtm1Q8K377 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrtm1Q8K377 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrtm1Q8K377 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrtm1Q8K377 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrtm1Q8K377 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrtm1Q8K377 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrrtm1Q8K377 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrrtm1Q8K377 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrrtm1Q8K377 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrrtm1Q8K377 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrrtm1Q8K377 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrrtm1Q8K377 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrrtm1Q8K377 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lrrtm1Q8K377 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lrrtm1Q8K377 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lrrtm1Q8K377 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lrrtm1Q8K377 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Lrrtm1Q8K377 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrtm1Q8K377 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrtm1Q8K377 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrtm1Q8K377 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrtm1Q8K377 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrtm1Q8K377 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrtm1Q8K377 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrtm1Q8K377 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrtm1Q8K377 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrtm1Q8K377 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrtm1Q8K377 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrtm1Q8K377 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrtm1Q8K377 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrtm1Q8K377 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrtm1Q8K377 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrtm1Q8K377 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrtm1Q8K377 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrtm1Q8K377 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrtm1Q8K377 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrtm1Q8K377 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrtm1Q8K377 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrtm1Q8K377 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrtm1Q8K377 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrtm1Q8K377 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrtm1Q8K377 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrtm1Q8K377 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrtm1Q8K377 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrtm1Q8K377 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrtm1Q8K377 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrtm1Q8K377 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrtm1Q8K377 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrtm1Q8K377 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrtm1Q8K377 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrtm1Q8K377 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrtm1Q8K377 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrtm1Q8K377 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrtm1Q8K377 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrtm1Q8K377 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrtm1Q8K377 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrtm1Q8K377 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrtm1Q8K377 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrtm1Q8K377 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrtm1Q8K377 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrtm1Q8K377 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrtm1Q8K377 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrtm1Q8K377 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrtm1Q8K377 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrtm1Q8K377 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrtm1Q8K377 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrrtm1Q8K377 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms