Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z4

Ncapd2, Condensin complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd2Q8K2Z4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ncapd2Q8K2Z4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ncapd2Q8K2Z4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ncapd2Q8K2Z4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ncapd2Q8K2Z4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ncapd2Q8K2Z4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ncapd2Q8K2Z4 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ncapd2Q8K2Z4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Ncapd2Q8K2Z4 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ncapd2Q8K2Z4 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ncapd2Q8K2Z4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ncapd2Q8K2Z4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ncapd2Q8K2Z4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ncapd2Q8K2Z4 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ncapd2Q8K2Z4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ncapd2Q8K2Z4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ncapd2Q8K2Z4 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ncapd2Q8K2Z4 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Ncapd2Q8K2Z4 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ncapd2Q8K2Z4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ncapd2Q8K2Z4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ncapd2Q8K2Z4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ncapd2Q8K2Z4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ncapd2Q8K2Z4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ncapd2Q8K2Z4 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ncapd2Q8K2Z4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ncapd2Q8K2Z4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ncapd2Q8K2Z4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ncapd2Q8K2Z4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ncapd2Q8K2Z4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Ncapd2Q8K2Z4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ncapd2Q8K2Z4 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ncapd2Q8K2Z4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ncapd2Q8K2Z4 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Ncapd2Q8K2Z4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ncapd2Q8K2Z4 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ncapd2Q8K2Z4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ncapd2Q8K2Z4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ncapd2Q8K2Z4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Ncapd2Q8K2Z4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ncapd2Q8K2Z4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ncapd2Q8K2Z4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ncapd2Q8K2Z4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ncapd2Q8K2Z4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ncapd2Q8K2Z4 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ncapd2Q8K2Z4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ncapd2Q8K2Z4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Ncapd2Q8K2Z4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ncapd2Q8K2Z4 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ncapd2Q8K2Z4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ncapd2Q8K2Z4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ncapd2Q8K2Z4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ncapd2Q8K2Z4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ncapd2Q8K2Z4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ncapd2Q8K2Z4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ncapd2Q8K2Z4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ncapd2Q8K2Z4 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ncapd2Q8K2Z4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ncapd2Q8K2Z4 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ncapd2Q8K2Z4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ncapd2Q8K2Z4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ncapd2Q8K2Z4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ncapd2Q8K2Z4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ncapd2Q8K2Z4 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ncapd2Q8K2Z4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ncapd2Q8K2Z4 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ncapd2Q8K2Z4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ncapd2Q8K2Z4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ncapd2Q8K2Z4 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ncapd2Q8K2Z4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ncapd2Q8K2Z4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ncapd2Q8K2Z4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ncapd2Q8K2Z4 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ncapd2Q8K2Z4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ncapd2Q8K2Z4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ncapd2Q8K2Z4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ncapd2Q8K2Z4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ncapd2Q8K2Z4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ncapd2Q8K2Z4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ncapd2Q8K2Z4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ncapd2Q8K2Z4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ncapd2Q8K2Z4 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Ncapd2Q8K2Z4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ncapd2Q8K2Z4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Ncapd2Q8K2Z4 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ncapd2Q8K2Z4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ncapd2Q8K2Z4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ncapd2Q8K2Z4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ncapd2Q8K2Z4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ncapd2Q8K2Z4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ncapd2Q8K2Z4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ncapd2Q8K2Z4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Ncapd2Q8K2Z4 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ncapd2Q8K2Z4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ncapd2Q8K2Z4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ncapd2Q8K2Z4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ncapd2Q8K2Z4 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ncapd2Q8K2Z4 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ncapd2Q8K2Z4 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Ncapd2Q8K2Z4 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms