Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Abcf3Q8K268 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Abcf3Q8K268 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Abcf3Q8K268 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Abcf3Q8K268 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Abcf3Q8K268 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Abcf3Q8K268 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Abcf3Q8K268 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Abcf3Q8K268 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Abcf3Q8K268 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Abcf3Q8K268 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Abcf3Q8K268 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Abcf3Q8K268 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Abcf3Q8K268 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Abcf3Q8K268 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Abcf3Q8K268 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Abcf3Q8K268 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Abcf3Q8K268 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Abcf3Q8K268 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Abcf3Q8K268 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Abcf3Q8K268 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Abcf3Q8K268 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Abcf3Q8K268 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Abcf3Q8K268 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Abcf3Q8K268 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Abcf3Q8K268 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Abcf3Q8K268 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Abcf3Q8K268 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Abcf3Q8K268 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Abcf3Q8K268 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Abcf3Q8K268 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Abcf3Q8K268 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Abcf3Q8K268 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Abcf3Q8K268 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Abcf3Q8K268 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Abcf3Q8K268 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Abcf3Q8K268 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Abcf3Q8K268 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Abcf3Q8K268 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Abcf3Q8K268 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Abcf3Q8K268 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Abcf3Q8K268 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Abcf3Q8K268 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Abcf3Q8K268 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Abcf3Q8K268 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Abcf3Q8K268 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Abcf3Q8K268 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Abcf3Q8K268 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Abcf3Q8K268 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Abcf3Q8K268 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Abcf3Q8K268 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Abcf3Q8K268 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Abcf3Q8K268 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Abcf3Q8K268 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Abcf3Q8K268 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Abcf3Q8K268 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Abcf3Q8K268 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Abcf3Q8K268 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Abcf3Q8K268 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Abcf3Q8K268 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Abcf3Q8K268 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Abcf3Q8K268 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Abcf3Q8K268 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Abcf3Q8K268 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Abcf3Q8K268 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Abcf3Q8K268 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Abcf3Q8K268 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Abcf3Q8K268 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Abcf3Q8K268 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Abcf3Q8K268 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Abcf3Q8K268 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Abcf3Q8K268 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Abcf3Q8K268 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Abcf3Q8K268 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Abcf3Q8K268 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Abcf3Q8K268 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Abcf3Q8K268 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Abcf3Q8K268 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Abcf3Q8K268 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Abcf3Q8K268 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Abcf3Q8K268 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Abcf3Q8K268 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Abcf3Q8K268 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Abcf3Q8K268 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Abcf3Q8K268 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Abcf3Q8K268 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Abcf3Q8K268 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Abcf3Q8K268 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Abcf3Q8K268 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Abcf3Q8K268 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Abcf3Q8K268 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Abcf3Q8K268 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Abcf3Q8K268 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Abcf3Q8K268 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Abcf3Q8K268 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Abcf3Q8K268 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Abcf3Q8K268 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Abcf3Q8K268 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Abcf3Q8K268 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Abcf3Q8K268 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms