Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1S6

Spire2, Protein spire homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire2Q8K1S6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Spire2Q8K1S6 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Spire2Q8K1S6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Spire2Q8K1S6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Spire2Q8K1S6 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Spire2Q8K1S6 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Spire2Q8K1S6 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Spire2Q8K1S6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Spire2Q8K1S6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Spire2Q8K1S6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Spire2Q8K1S6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Spire2Q8K1S6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Spire2Q8K1S6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Spire2Q8K1S6 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Spire2Q8K1S6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Spire2Q8K1S6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Spire2Q8K1S6 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Spire2Q8K1S6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Spire2Q8K1S6 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Spire2Q8K1S6 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Spire2Q8K1S6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Spire2Q8K1S6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Spire2Q8K1S6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Spire2Q8K1S6 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Spire2Q8K1S6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Spire2Q8K1S6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Spire2Q8K1S6 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Spire2Q8K1S6 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Spire2Q8K1S6 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Spire2Q8K1S6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Spire2Q8K1S6 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Spire2Q8K1S6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Spire2Q8K1S6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Spire2Q8K1S6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Spire2Q8K1S6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Spire2Q8K1S6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Spire2Q8K1S6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Spire2Q8K1S6 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Spire2Q8K1S6 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Spire2Q8K1S6 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Spire2Q8K1S6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Spire2Q8K1S6 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Spire2Q8K1S6 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Spire2Q8K1S6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Spire2Q8K1S6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Spire2Q8K1S6 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Spire2Q8K1S6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Spire2Q8K1S6 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Spire2Q8K1S6 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Spire2Q8K1S6 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Spire2Q8K1S6 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Spire2Q8K1S6 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Spire2Q8K1S6 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Spire2Q8K1S6 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Spire2Q8K1S6 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Spire2Q8K1S6 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Spire2Q8K1S6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Spire2Q8K1S6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Spire2Q8K1S6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Spire2Q8K1S6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Spire2Q8K1S6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Spire2Q8K1S6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Spire2Q8K1S6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Spire2Q8K1S6 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Spire2Q8K1S6 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Spire2Q8K1S6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Spire2Q8K1S6 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Spire2Q8K1S6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Spire2Q8K1S6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Spire2Q8K1S6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Spire2Q8K1S6 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Spire2Q8K1S6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Spire2Q8K1S6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Spire2Q8K1S6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Spire2Q8K1S6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Spire2Q8K1S6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Spire2Q8K1S6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Spire2Q8K1S6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Spire2Q8K1S6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Spire2Q8K1S6 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Spire2Q8K1S6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Spire2Q8K1S6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Spire2Q8K1S6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Spire2Q8K1S6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Spire2Q8K1S6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Spire2Q8K1S6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Spire2Q8K1S6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Spire2Q8K1S6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Spire2Q8K1S6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Spire2Q8K1S6 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Spire2Q8K1S6 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Spire2Q8K1S6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Spire2Q8K1S6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Spire2Q8K1S6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Spire2Q8K1S6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Spire2Q8K1S6 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Spire2Q8K1S6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Spire2Q8K1S6 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Spire2Q8K1S6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Spire2Q8K1S6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms