Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1E0

Stx5, Syntaxin-5, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx5Q8K1E0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stx5Q8K1E0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stx5Q8K1E0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stx5Q8K1E0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stx5Q8K1E0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stx5Q8K1E0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stx5Q8K1E0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stx5Q8K1E0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stx5Q8K1E0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stx5Q8K1E0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stx5Q8K1E0 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stx5Q8K1E0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stx5Q8K1E0 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Stx5Q8K1E0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Stx5Q8K1E0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Stx5Q8K1E0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Stx5Q8K1E0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stx5Q8K1E0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stx5Q8K1E0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stx5Q8K1E0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stx5Q8K1E0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stx5Q8K1E0 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stx5Q8K1E0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stx5Q8K1E0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stx5Q8K1E0 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stx5Q8K1E0 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stx5Q8K1E0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stx5Q8K1E0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stx5Q8K1E0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stx5Q8K1E0 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stx5Q8K1E0 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stx5Q8K1E0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stx5Q8K1E0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stx5Q8K1E0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stx5Q8K1E0 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stx5Q8K1E0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Stx5Q8K1E0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stx5Q8K1E0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stx5Q8K1E0 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stx5Q8K1E0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stx5Q8K1E0 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stx5Q8K1E0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stx5Q8K1E0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stx5Q8K1E0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stx5Q8K1E0 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stx5Q8K1E0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stx5Q8K1E0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stx5Q8K1E0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stx5Q8K1E0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stx5Q8K1E0 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stx5Q8K1E0 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stx5Q8K1E0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stx5Q8K1E0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stx5Q8K1E0 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stx5Q8K1E0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stx5Q8K1E0 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stx5Q8K1E0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stx5Q8K1E0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stx5Q8K1E0 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stx5Q8K1E0 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stx5Q8K1E0 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stx5Q8K1E0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stx5Q8K1E0 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stx5Q8K1E0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stx5Q8K1E0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stx5Q8K1E0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stx5Q8K1E0 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stx5Q8K1E0 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stx5Q8K1E0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stx5Q8K1E0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Stx5Q8K1E0 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stx5Q8K1E0 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stx5Q8K1E0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Stx5Q8K1E0 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stx5Q8K1E0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Stx5Q8K1E0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Stx5Q8K1E0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stx5Q8K1E0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stx5Q8K1E0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stx5Q8K1E0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stx5Q8K1E0 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stx5Q8K1E0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stx5Q8K1E0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stx5Q8K1E0 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stx5Q8K1E0 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stx5Q8K1E0 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stx5Q8K1E0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stx5Q8K1E0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stx5Q8K1E0 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stx5Q8K1E0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stx5Q8K1E0 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stx5Q8K1E0 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stx5Q8K1E0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Stx5Q8K1E0 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stx5Q8K1E0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stx5Q8K1E0 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stx5Q8K1E0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stx5Q8K1E0 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stx5Q8K1E0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stx5Q8K1E0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms