Protein–RNA interactions for Protein: Q8K136

Scnm1, Sodium channel modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnm1Q8K136 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scnm1Q8K136 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scnm1Q8K136 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scnm1Q8K136 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scnm1Q8K136 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scnm1Q8K136 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scnm1Q8K136 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scnm1Q8K136 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scnm1Q8K136 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scnm1Q8K136 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scnm1Q8K136 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Scnm1Q8K136 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scnm1Q8K136 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scnm1Q8K136 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scnm1Q8K136 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scnm1Q8K136 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scnm1Q8K136 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Scnm1Q8K136 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scnm1Q8K136 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scnm1Q8K136 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scnm1Q8K136 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scnm1Q8K136 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scnm1Q8K136 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scnm1Q8K136 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scnm1Q8K136 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scnm1Q8K136 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scnm1Q8K136 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scnm1Q8K136 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scnm1Q8K136 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scnm1Q8K136 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scnm1Q8K136 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scnm1Q8K136 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scnm1Q8K136 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scnm1Q8K136 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scnm1Q8K136 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scnm1Q8K136 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Scnm1Q8K136 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Scnm1Q8K136 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scnm1Q8K136 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scnm1Q8K136 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scnm1Q8K136 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scnm1Q8K136 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scnm1Q8K136 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scnm1Q8K136 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scnm1Q8K136 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Scnm1Q8K136 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scnm1Q8K136 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scnm1Q8K136 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scnm1Q8K136 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scnm1Q8K136 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scnm1Q8K136 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Scnm1Q8K136 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scnm1Q8K136 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scnm1Q8K136 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scnm1Q8K136 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scnm1Q8K136 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scnm1Q8K136 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scnm1Q8K136 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scnm1Q8K136 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scnm1Q8K136 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Scnm1Q8K136 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scnm1Q8K136 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scnm1Q8K136 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scnm1Q8K136 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Scnm1Q8K136 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scnm1Q8K136 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scnm1Q8K136 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scnm1Q8K136 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scnm1Q8K136 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scnm1Q8K136 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scnm1Q8K136 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scnm1Q8K136 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scnm1Q8K136 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scnm1Q8K136 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scnm1Q8K136 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scnm1Q8K136 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scnm1Q8K136 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scnm1Q8K136 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scnm1Q8K136 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Scnm1Q8K136 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scnm1Q8K136 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scnm1Q8K136 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scnm1Q8K136 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scnm1Q8K136 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scnm1Q8K136 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scnm1Q8K136 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scnm1Q8K136 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scnm1Q8K136 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Scnm1Q8K136 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scnm1Q8K136 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scnm1Q8K136 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scnm1Q8K136 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scnm1Q8K136 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scnm1Q8K136 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scnm1Q8K136 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scnm1Q8K136 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scnm1Q8K136 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Scnm1Q8K136 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Scnm1Q8K136 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scnm1Q8K136 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms