Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LgsnQ8CIX8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LgsnQ8CIX8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LgsnQ8CIX8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LgsnQ8CIX8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LgsnQ8CIX8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LgsnQ8CIX8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LgsnQ8CIX8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LgsnQ8CIX8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LgsnQ8CIX8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LgsnQ8CIX8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LgsnQ8CIX8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LgsnQ8CIX8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LgsnQ8CIX8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LgsnQ8CIX8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LgsnQ8CIX8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
LgsnQ8CIX8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LgsnQ8CIX8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LgsnQ8CIX8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LgsnQ8CIX8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LgsnQ8CIX8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LgsnQ8CIX8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LgsnQ8CIX8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
LgsnQ8CIX8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LgsnQ8CIX8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
LgsnQ8CIX8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LgsnQ8CIX8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LgsnQ8CIX8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LgsnQ8CIX8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LgsnQ8CIX8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LgsnQ8CIX8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LgsnQ8CIX8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LgsnQ8CIX8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LgsnQ8CIX8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LgsnQ8CIX8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LgsnQ8CIX8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
LgsnQ8CIX8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LgsnQ8CIX8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LgsnQ8CIX8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LgsnQ8CIX8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LgsnQ8CIX8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LgsnQ8CIX8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
LgsnQ8CIX8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
LgsnQ8CIX8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LgsnQ8CIX8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LgsnQ8CIX8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
LgsnQ8CIX8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LgsnQ8CIX8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LgsnQ8CIX8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LgsnQ8CIX8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LgsnQ8CIX8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LgsnQ8CIX8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
LgsnQ8CIX8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
LgsnQ8CIX8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LgsnQ8CIX8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LgsnQ8CIX8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LgsnQ8CIX8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LgsnQ8CIX8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LgsnQ8CIX8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LgsnQ8CIX8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LgsnQ8CIX8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LgsnQ8CIX8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LgsnQ8CIX8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LgsnQ8CIX8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LgsnQ8CIX8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LgsnQ8CIX8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LgsnQ8CIX8 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LgsnQ8CIX8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LgsnQ8CIX8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LgsnQ8CIX8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LgsnQ8CIX8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LgsnQ8CIX8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LgsnQ8CIX8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LgsnQ8CIX8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LgsnQ8CIX8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LgsnQ8CIX8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LgsnQ8CIX8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LgsnQ8CIX8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
LgsnQ8CIX8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LgsnQ8CIX8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LgsnQ8CIX8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LgsnQ8CIX8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LgsnQ8CIX8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LgsnQ8CIX8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LgsnQ8CIX8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LgsnQ8CIX8 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LgsnQ8CIX8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LgsnQ8CIX8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LgsnQ8CIX8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LgsnQ8CIX8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LgsnQ8CIX8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LgsnQ8CIX8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LgsnQ8CIX8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LgsnQ8CIX8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LgsnQ8CIX8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LgsnQ8CIX8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LgsnQ8CIX8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LgsnQ8CIX8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LgsnQ8CIX8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LgsnQ8CIX8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms