Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH25

Sltm, SAFB-like transcription modulator, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SltmQ8CH25 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SltmQ8CH25 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SltmQ8CH25 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SltmQ8CH25 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SltmQ8CH25 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SltmQ8CH25 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SltmQ8CH25 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SltmQ8CH25 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SltmQ8CH25 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SltmQ8CH25 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SltmQ8CH25 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SltmQ8CH25 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SltmQ8CH25 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SltmQ8CH25 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SltmQ8CH25 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SltmQ8CH25 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SltmQ8CH25 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SltmQ8CH25 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SltmQ8CH25 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SltmQ8CH25 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SltmQ8CH25 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SltmQ8CH25 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SltmQ8CH25 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SltmQ8CH25 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SltmQ8CH25 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SltmQ8CH25 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SltmQ8CH25 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SltmQ8CH25 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SltmQ8CH25 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SltmQ8CH25 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SltmQ8CH25 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SltmQ8CH25 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SltmQ8CH25 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SltmQ8CH25 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SltmQ8CH25 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SltmQ8CH25 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SltmQ8CH25 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SltmQ8CH25 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SltmQ8CH25 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SltmQ8CH25 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SltmQ8CH25 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SltmQ8CH25 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SltmQ8CH25 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SltmQ8CH25 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SltmQ8CH25 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SltmQ8CH25 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SltmQ8CH25 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SltmQ8CH25 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SltmQ8CH25 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SltmQ8CH25 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SltmQ8CH25 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SltmQ8CH25 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SltmQ8CH25 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SltmQ8CH25 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SltmQ8CH25 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SltmQ8CH25 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SltmQ8CH25 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SltmQ8CH25 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SltmQ8CH25 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SltmQ8CH25 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SltmQ8CH25 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SltmQ8CH25 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SltmQ8CH25 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SltmQ8CH25 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SltmQ8CH25 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SltmQ8CH25 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SltmQ8CH25 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SltmQ8CH25 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SltmQ8CH25 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SltmQ8CH25 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SltmQ8CH25 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SltmQ8CH25 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SltmQ8CH25 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SltmQ8CH25 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SltmQ8CH25 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SltmQ8CH25 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SltmQ8CH25 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SltmQ8CH25 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SltmQ8CH25 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SltmQ8CH25 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SltmQ8CH25 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SltmQ8CH25 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SltmQ8CH25 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SltmQ8CH25 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SltmQ8CH25 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SltmQ8CH25 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SltmQ8CH25 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SltmQ8CH25 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SltmQ8CH25 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SltmQ8CH25 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SltmQ8CH25 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SltmQ8CH25 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SltmQ8CH25 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SltmQ8CH25 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SltmQ8CH25 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SltmQ8CH25 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SltmQ8CH25 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SltmQ8CH25 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SltmQ8CH25 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SltmQ8CH25 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms