Protein–RNA interactions for Protein: Q8CG47

Smc4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc4Q8CG47 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smc4Q8CG47 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smc4Q8CG47 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smc4Q8CG47 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smc4Q8CG47 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smc4Q8CG47 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smc4Q8CG47 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smc4Q8CG47 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smc4Q8CG47 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smc4Q8CG47 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smc4Q8CG47 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smc4Q8CG47 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smc4Q8CG47 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smc4Q8CG47 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smc4Q8CG47 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smc4Q8CG47 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smc4Q8CG47 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smc4Q8CG47 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smc4Q8CG47 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smc4Q8CG47 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smc4Q8CG47 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smc4Q8CG47 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smc4Q8CG47 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smc4Q8CG47 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smc4Q8CG47 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smc4Q8CG47 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smc4Q8CG47 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smc4Q8CG47 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Smc4Q8CG47 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smc4Q8CG47 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smc4Q8CG47 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smc4Q8CG47 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smc4Q8CG47 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smc4Q8CG47 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smc4Q8CG47 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smc4Q8CG47 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smc4Q8CG47 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smc4Q8CG47 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smc4Q8CG47 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smc4Q8CG47 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smc4Q8CG47 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smc4Q8CG47 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smc4Q8CG47 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smc4Q8CG47 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smc4Q8CG47 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smc4Q8CG47 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smc4Q8CG47 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smc4Q8CG47 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smc4Q8CG47 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smc4Q8CG47 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smc4Q8CG47 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smc4Q8CG47 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Smc4Q8CG47 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smc4Q8CG47 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Smc4Q8CG47 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smc4Q8CG47 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smc4Q8CG47 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smc4Q8CG47 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smc4Q8CG47 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Smc4Q8CG47 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smc4Q8CG47 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smc4Q8CG47 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smc4Q8CG47 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smc4Q8CG47 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smc4Q8CG47 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smc4Q8CG47 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smc4Q8CG47 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smc4Q8CG47 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smc4Q8CG47 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smc4Q8CG47 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smc4Q8CG47 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smc4Q8CG47 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smc4Q8CG47 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smc4Q8CG47 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smc4Q8CG47 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smc4Q8CG47 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smc4Q8CG47 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Smc4Q8CG47 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smc4Q8CG47 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smc4Q8CG47 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smc4Q8CG47 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smc4Q8CG47 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smc4Q8CG47 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smc4Q8CG47 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smc4Q8CG47 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smc4Q8CG47 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smc4Q8CG47 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smc4Q8CG47 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smc4Q8CG47 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smc4Q8CG47 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smc4Q8CG47 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smc4Q8CG47 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smc4Q8CG47 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smc4Q8CG47 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smc4Q8CG47 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smc4Q8CG47 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smc4Q8CG47 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smc4Q8CG47 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smc4Q8CG47 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smc4Q8CG47 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms