Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFK2

Brf1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, mousemouse

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Length 676 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf1Q8CFK2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Brf1Q8CFK2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Brf1Q8CFK2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Brf1Q8CFK2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brf1Q8CFK2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brf1Q8CFK2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brf1Q8CFK2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brf1Q8CFK2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brf1Q8CFK2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brf1Q8CFK2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brf1Q8CFK2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brf1Q8CFK2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Brf1Q8CFK2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Brf1Q8CFK2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Brf1Q8CFK2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brf1Q8CFK2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brf1Q8CFK2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brf1Q8CFK2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brf1Q8CFK2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Brf1Q8CFK2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Brf1Q8CFK2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Brf1Q8CFK2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Brf1Q8CFK2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Brf1Q8CFK2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Brf1Q8CFK2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Brf1Q8CFK2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Brf1Q8CFK2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Brf1Q8CFK2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Brf1Q8CFK2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Brf1Q8CFK2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Brf1Q8CFK2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Brf1Q8CFK2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Brf1Q8CFK2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Brf1Q8CFK2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Brf1Q8CFK2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Brf1Q8CFK2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Brf1Q8CFK2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Brf1Q8CFK2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Brf1Q8CFK2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Brf1Q8CFK2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Brf1Q8CFK2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Brf1Q8CFK2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Brf1Q8CFK2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Brf1Q8CFK2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Brf1Q8CFK2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Brf1Q8CFK2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Brf1Q8CFK2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Brf1Q8CFK2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Brf1Q8CFK2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Brf1Q8CFK2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Brf1Q8CFK2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Brf1Q8CFK2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Brf1Q8CFK2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Brf1Q8CFK2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Brf1Q8CFK2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brf1Q8CFK2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brf1Q8CFK2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brf1Q8CFK2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brf1Q8CFK2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brf1Q8CFK2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brf1Q8CFK2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brf1Q8CFK2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brf1Q8CFK2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brf1Q8CFK2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Brf1Q8CFK2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Brf1Q8CFK2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Brf1Q8CFK2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Brf1Q8CFK2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Brf1Q8CFK2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Brf1Q8CFK2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Brf1Q8CFK2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Brf1Q8CFK2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Brf1Q8CFK2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Brf1Q8CFK2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Brf1Q8CFK2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Brf1Q8CFK2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Brf1Q8CFK2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Brf1Q8CFK2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Brf1Q8CFK2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Brf1Q8CFK2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Brf1Q8CFK2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Brf1Q8CFK2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Brf1Q8CFK2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Brf1Q8CFK2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Brf1Q8CFK2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Brf1Q8CFK2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Brf1Q8CFK2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Brf1Q8CFK2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Brf1Q8CFK2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Brf1Q8CFK2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Brf1Q8CFK2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Brf1Q8CFK2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Brf1Q8CFK2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Brf1Q8CFK2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Brf1Q8CFK2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Brf1Q8CFK2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Brf1Q8CFK2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Brf1Q8CFK2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Brf1Q8CFK2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Brf1Q8CFK2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
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