Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Usp27Q8CEG8 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Usp27Q8CEG8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Usp27Q8CEG8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Usp27Q8CEG8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Usp27Q8CEG8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Usp27Q8CEG8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Usp27Q8CEG8 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Usp27Q8CEG8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Usp27Q8CEG8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Usp27Q8CEG8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Usp27Q8CEG8 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Usp27Q8CEG8 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Usp27Q8CEG8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Usp27Q8CEG8 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Usp27Q8CEG8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Usp27Q8CEG8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Usp27Q8CEG8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Usp27Q8CEG8 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Usp27Q8CEG8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Usp27Q8CEG8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Usp27Q8CEG8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Usp27Q8CEG8 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp27Q8CEG8 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp27Q8CEG8 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp27Q8CEG8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp27Q8CEG8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp27Q8CEG8 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp27Q8CEG8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp27Q8CEG8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp27Q8CEG8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp27Q8CEG8 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp27Q8CEG8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp27Q8CEG8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp27Q8CEG8 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp27Q8CEG8 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp27Q8CEG8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp27Q8CEG8 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp27Q8CEG8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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Usp27Q8CEG8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp27Q8CEG8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp27Q8CEG8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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Usp27Q8CEG8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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Usp27Q8CEG8 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp27Q8CEG8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp27Q8CEG8 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp27Q8CEG8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp27Q8CEG8 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp27Q8CEG8 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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Usp27Q8CEG8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp27Q8CEG8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp27Q8CEG8 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
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Usp27Q8CEG8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp27Q8CEG8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
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Usp27Q8CEG8 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
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Usp27Q8CEG8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
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Usp27Q8CEG8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp27Q8CEG8 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp27Q8CEG8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
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Usp27Q8CEG8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
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Usp27Q8CEG8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp27Q8CEG8 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp27Q8CEG8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp27Q8CEG8 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp27Q8CEG8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp27Q8CEG8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp27Q8CEG8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp27Q8CEG8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp27Q8CEG8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp27Q8CEG8 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp27Q8CEG8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp27Q8CEG8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp27Q8CEG8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp27Q8CEG8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp27Q8CEG8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp27Q8CEG8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp27Q8CEG8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp27Q8CEG8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp27Q8CEG8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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