Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV0

Ccdc178, Coiled-coil domain-containing protein 178, mousemouse

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc178Q8CDV0 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc178Q8CDV0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc178Q8CDV0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc178Q8CDV0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc178Q8CDV0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc178Q8CDV0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc178Q8CDV0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc178Q8CDV0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc178Q8CDV0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc178Q8CDV0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc178Q8CDV0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc178Q8CDV0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc178Q8CDV0 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc178Q8CDV0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc178Q8CDV0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc178Q8CDV0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc178Q8CDV0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc178Q8CDV0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc178Q8CDV0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc178Q8CDV0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc178Q8CDV0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc178Q8CDV0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc178Q8CDV0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc178Q8CDV0 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc178Q8CDV0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc178Q8CDV0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc178Q8CDV0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc178Q8CDV0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc178Q8CDV0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc178Q8CDV0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc178Q8CDV0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc178Q8CDV0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc178Q8CDV0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc178Q8CDV0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc178Q8CDV0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc178Q8CDV0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc178Q8CDV0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc178Q8CDV0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc178Q8CDV0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc178Q8CDV0 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc178Q8CDV0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc178Q8CDV0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc178Q8CDV0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc178Q8CDV0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc178Q8CDV0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc178Q8CDV0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc178Q8CDV0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc178Q8CDV0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc178Q8CDV0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc178Q8CDV0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc178Q8CDV0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc178Q8CDV0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc178Q8CDV0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc178Q8CDV0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc178Q8CDV0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc178Q8CDV0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc178Q8CDV0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc178Q8CDV0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc178Q8CDV0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc178Q8CDV0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc178Q8CDV0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc178Q8CDV0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc178Q8CDV0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc178Q8CDV0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc178Q8CDV0 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc178Q8CDV0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc178Q8CDV0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc178Q8CDV0 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc178Q8CDV0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc178Q8CDV0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc178Q8CDV0 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc178Q8CDV0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc178Q8CDV0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc178Q8CDV0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc178Q8CDV0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc178Q8CDV0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc178Q8CDV0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc178Q8CDV0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc178Q8CDV0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc178Q8CDV0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc178Q8CDV0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc178Q8CDV0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc178Q8CDV0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc178Q8CDV0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc178Q8CDV0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc178Q8CDV0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc178Q8CDV0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc178Q8CDV0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc178Q8CDV0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc178Q8CDV0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc178Q8CDV0 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc178Q8CDV0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc178Q8CDV0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc178Q8CDV0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc178Q8CDV0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc178Q8CDV0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc178Q8CDV0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc178Q8CDV0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc178Q8CDV0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc178Q8CDV0 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms