Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Lrrc9Q8CDN9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Lrrc9Q8CDN9 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Lrrc9Q8CDN9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Lrrc9Q8CDN9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Lrrc9Q8CDN9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Lrrc9Q8CDN9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Lrrc9Q8CDN9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Lrrc9Q8CDN9 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Lrrc9Q8CDN9 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Lrrc9Q8CDN9 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Lrrc9Q8CDN9 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Lrrc9Q8CDN9 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Lrrc9Q8CDN9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Lrrc9Q8CDN9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Lrrc9Q8CDN9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Lrrc9Q8CDN9 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Lrrc9Q8CDN9 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Lrrc9Q8CDN9 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Lrrc9Q8CDN9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Lrrc9Q8CDN9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Lrrc9Q8CDN9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Lrrc9Q8CDN9 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Lrrc9Q8CDN9 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Lrrc9Q8CDN9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Lrrc9Q8CDN9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Lrrc9Q8CDN9 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Lrrc9Q8CDN9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Lrrc9Q8CDN9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Lrrc9Q8CDN9 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Lrrc9Q8CDN9 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Lrrc9Q8CDN9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Lrrc9Q8CDN9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Lrrc9Q8CDN9 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Lrrc9Q8CDN9 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Lrrc9Q8CDN9 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Lrrc9Q8CDN9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Lrrc9Q8CDN9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Lrrc9Q8CDN9 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Lrrc9Q8CDN9 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Lrrc9Q8CDN9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Lrrc9Q8CDN9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Lrrc9Q8CDN9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Lrrc9Q8CDN9 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Lrrc9Q8CDN9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Lrrc9Q8CDN9 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Lrrc9Q8CDN9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Lrrc9Q8CDN9 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Lrrc9Q8CDN9 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Lrrc9Q8CDN9 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Lrrc9Q8CDN9 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Lrrc9Q8CDN9 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Lrrc9Q8CDN9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Lrrc9Q8CDN9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Lrrc9Q8CDN9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Lrrc9Q8CDN9 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Lrrc9Q8CDN9 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Lrrc9Q8CDN9 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Lrrc9Q8CDN9 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Lrrc9Q8CDN9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Lrrc9Q8CDN9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Lrrc9Q8CDN9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Lrrc9Q8CDN9 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Lrrc9Q8CDN9 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Lrrc9Q8CDN9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Lrrc9Q8CDN9 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Lrrc9Q8CDN9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Lrrc9Q8CDN9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Lrrc9Q8CDN9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Lrrc9Q8CDN9 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Lrrc9Q8CDN9 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Lrrc9Q8CDN9 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Lrrc9Q8CDN9 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Lrrc9Q8CDN9 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Lrrc9Q8CDN9 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Lrrc9Q8CDN9 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Lrrc9Q8CDN9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Lrrc9Q8CDN9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Lrrc9Q8CDN9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Lrrc9Q8CDN9 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Lrrc9Q8CDN9 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Lrrc9Q8CDN9 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Lrrc9Q8CDN9 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Lrrc9Q8CDN9 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Lrrc9Q8CDN9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Lrrc9Q8CDN9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Lrrc9Q8CDN9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Lrrc9Q8CDN9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Lrrc9Q8CDN9 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Lrrc9Q8CDN9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Lrrc9Q8CDN9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Lrrc9Q8CDN9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Lrrc9Q8CDN9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Lrrc9Q8CDN9 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Lrrc9Q8CDN9 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Lrrc9Q8CDN9 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Lrrc9Q8CDN9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Lrrc9Q8CDN9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Lrrc9Q8CDN9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Lrrc9Q8CDN9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms