Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ3

Ufl1, E3 UFM1-protein ligase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufl1Q8CCJ3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ufl1Q8CCJ3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ufl1Q8CCJ3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ufl1Q8CCJ3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ufl1Q8CCJ3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ufl1Q8CCJ3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ufl1Q8CCJ3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ufl1Q8CCJ3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ufl1Q8CCJ3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ufl1Q8CCJ3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ufl1Q8CCJ3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ufl1Q8CCJ3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ufl1Q8CCJ3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ufl1Q8CCJ3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ufl1Q8CCJ3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ufl1Q8CCJ3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ufl1Q8CCJ3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ufl1Q8CCJ3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ufl1Q8CCJ3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ufl1Q8CCJ3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ufl1Q8CCJ3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ufl1Q8CCJ3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ufl1Q8CCJ3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ufl1Q8CCJ3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ufl1Q8CCJ3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ufl1Q8CCJ3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ufl1Q8CCJ3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ufl1Q8CCJ3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ufl1Q8CCJ3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ufl1Q8CCJ3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ufl1Q8CCJ3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ufl1Q8CCJ3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ufl1Q8CCJ3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ufl1Q8CCJ3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ufl1Q8CCJ3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ufl1Q8CCJ3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ufl1Q8CCJ3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ufl1Q8CCJ3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ufl1Q8CCJ3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ufl1Q8CCJ3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ufl1Q8CCJ3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ufl1Q8CCJ3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ufl1Q8CCJ3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ufl1Q8CCJ3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ufl1Q8CCJ3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ufl1Q8CCJ3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Ufl1Q8CCJ3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ufl1Q8CCJ3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ufl1Q8CCJ3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ufl1Q8CCJ3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ufl1Q8CCJ3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ufl1Q8CCJ3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ufl1Q8CCJ3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ufl1Q8CCJ3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ufl1Q8CCJ3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ufl1Q8CCJ3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ufl1Q8CCJ3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ufl1Q8CCJ3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ufl1Q8CCJ3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ufl1Q8CCJ3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ufl1Q8CCJ3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ufl1Q8CCJ3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ufl1Q8CCJ3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ufl1Q8CCJ3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ufl1Q8CCJ3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ufl1Q8CCJ3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ufl1Q8CCJ3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ufl1Q8CCJ3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ufl1Q8CCJ3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ufl1Q8CCJ3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ufl1Q8CCJ3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ufl1Q8CCJ3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ufl1Q8CCJ3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ufl1Q8CCJ3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ufl1Q8CCJ3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ufl1Q8CCJ3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ufl1Q8CCJ3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ufl1Q8CCJ3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ufl1Q8CCJ3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ufl1Q8CCJ3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ufl1Q8CCJ3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ufl1Q8CCJ3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ufl1Q8CCJ3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ufl1Q8CCJ3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ufl1Q8CCJ3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ufl1Q8CCJ3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ufl1Q8CCJ3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ufl1Q8CCJ3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ufl1Q8CCJ3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ufl1Q8CCJ3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ufl1Q8CCJ3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ufl1Q8CCJ3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ufl1Q8CCJ3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ufl1Q8CCJ3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ufl1Q8CCJ3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ufl1Q8CCJ3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ufl1Q8CCJ3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ufl1Q8CCJ3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ufl1Q8CCJ3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ufl1Q8CCJ3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms