Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBC6

Lrrn3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, mousemouse

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Length 707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn3Q8CBC6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrn3Q8CBC6 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrn3Q8CBC6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrn3Q8CBC6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrn3Q8CBC6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrn3Q8CBC6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrn3Q8CBC6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrn3Q8CBC6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrn3Q8CBC6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrn3Q8CBC6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrn3Q8CBC6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrn3Q8CBC6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrn3Q8CBC6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrn3Q8CBC6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrn3Q8CBC6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrn3Q8CBC6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrn3Q8CBC6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrrn3Q8CBC6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrrn3Q8CBC6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrrn3Q8CBC6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrrn3Q8CBC6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrrn3Q8CBC6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrrn3Q8CBC6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrrn3Q8CBC6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrrn3Q8CBC6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrrn3Q8CBC6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrrn3Q8CBC6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrrn3Q8CBC6 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrrn3Q8CBC6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrrn3Q8CBC6 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrrn3Q8CBC6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrrn3Q8CBC6 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrrn3Q8CBC6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrrn3Q8CBC6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrrn3Q8CBC6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrrn3Q8CBC6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrrn3Q8CBC6 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lrrn3Q8CBC6 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lrrn3Q8CBC6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lrrn3Q8CBC6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lrrn3Q8CBC6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrrn3Q8CBC6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrrn3Q8CBC6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrrn3Q8CBC6 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrrn3Q8CBC6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrrn3Q8CBC6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrrn3Q8CBC6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrrn3Q8CBC6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrrn3Q8CBC6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrrn3Q8CBC6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrrn3Q8CBC6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrrn3Q8CBC6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrrn3Q8CBC6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrrn3Q8CBC6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrrn3Q8CBC6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrrn3Q8CBC6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrrn3Q8CBC6 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrrn3Q8CBC6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrrn3Q8CBC6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrrn3Q8CBC6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrrn3Q8CBC6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrrn3Q8CBC6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrrn3Q8CBC6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrrn3Q8CBC6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrrn3Q8CBC6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrrn3Q8CBC6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrrn3Q8CBC6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrrn3Q8CBC6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrrn3Q8CBC6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrrn3Q8CBC6 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrrn3Q8CBC6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrrn3Q8CBC6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrrn3Q8CBC6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrrn3Q8CBC6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrrn3Q8CBC6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrn3Q8CBC6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrn3Q8CBC6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrn3Q8CBC6 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrn3Q8CBC6 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrn3Q8CBC6 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrn3Q8CBC6 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrn3Q8CBC6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrn3Q8CBC6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrn3Q8CBC6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrn3Q8CBC6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrn3Q8CBC6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrn3Q8CBC6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrn3Q8CBC6 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrn3Q8CBC6 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrn3Q8CBC6 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrn3Q8CBC6 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrrn3Q8CBC6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrrn3Q8CBC6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrrn3Q8CBC6 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrrn3Q8CBC6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrrn3Q8CBC6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrrn3Q8CBC6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrrn3Q8CBC6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrrn3Q8CBC6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrrn3Q8CBC6 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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