Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAT8

Fbxo48, F-box only protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo48Q8CAT8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fbxo48Q8CAT8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Fbxo48Q8CAT8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fbxo48Q8CAT8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Fbxo48Q8CAT8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fbxo48Q8CAT8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fbxo48Q8CAT8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Fbxo48Q8CAT8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fbxo48Q8CAT8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fbxo48Q8CAT8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fbxo48Q8CAT8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fbxo48Q8CAT8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fbxo48Q8CAT8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fbxo48Q8CAT8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fbxo48Q8CAT8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fbxo48Q8CAT8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Fbxo48Q8CAT8 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fbxo48Q8CAT8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fbxo48Q8CAT8 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fbxo48Q8CAT8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fbxo48Q8CAT8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fbxo48Q8CAT8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fbxo48Q8CAT8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fbxo48Q8CAT8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fbxo48Q8CAT8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fbxo48Q8CAT8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fbxo48Q8CAT8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fbxo48Q8CAT8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fbxo48Q8CAT8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fbxo48Q8CAT8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fbxo48Q8CAT8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fbxo48Q8CAT8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fbxo48Q8CAT8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fbxo48Q8CAT8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fbxo48Q8CAT8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fbxo48Q8CAT8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fbxo48Q8CAT8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fbxo48Q8CAT8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fbxo48Q8CAT8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fbxo48Q8CAT8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fbxo48Q8CAT8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fbxo48Q8CAT8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fbxo48Q8CAT8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fbxo48Q8CAT8 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fbxo48Q8CAT8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fbxo48Q8CAT8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Fbxo48Q8CAT8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Fbxo48Q8CAT8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fbxo48Q8CAT8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fbxo48Q8CAT8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fbxo48Q8CAT8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fbxo48Q8CAT8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fbxo48Q8CAT8 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fbxo48Q8CAT8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fbxo48Q8CAT8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fbxo48Q8CAT8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fbxo48Q8CAT8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fbxo48Q8CAT8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fbxo48Q8CAT8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fbxo48Q8CAT8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fbxo48Q8CAT8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fbxo48Q8CAT8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fbxo48Q8CAT8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fbxo48Q8CAT8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Fbxo48Q8CAT8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fbxo48Q8CAT8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fbxo48Q8CAT8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fbxo48Q8CAT8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fbxo48Q8CAT8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fbxo48Q8CAT8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fbxo48Q8CAT8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fbxo48Q8CAT8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fbxo48Q8CAT8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fbxo48Q8CAT8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fbxo48Q8CAT8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fbxo48Q8CAT8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fbxo48Q8CAT8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fbxo48Q8CAT8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fbxo48Q8CAT8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fbxo48Q8CAT8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fbxo48Q8CAT8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fbxo48Q8CAT8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fbxo48Q8CAT8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fbxo48Q8CAT8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fbxo48Q8CAT8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fbxo48Q8CAT8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fbxo48Q8CAT8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fbxo48Q8CAT8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fbxo48Q8CAT8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fbxo48Q8CAT8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fbxo48Q8CAT8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fbxo48Q8CAT8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Fbxo48Q8CAT8 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Fbxo48Q8CAT8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fbxo48Q8CAT8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fbxo48Q8CAT8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Fbxo48Q8CAT8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fbxo48Q8CAT8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fbxo48Q8CAT8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fbxo48Q8CAT8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms