Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAF4

Nhsl1, NHS-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,587 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhsl1Q8CAF4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nhsl1Q8CAF4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nhsl1Q8CAF4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nhsl1Q8CAF4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nhsl1Q8CAF4 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nhsl1Q8CAF4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nhsl1Q8CAF4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nhsl1Q8CAF4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nhsl1Q8CAF4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nhsl1Q8CAF4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Nhsl1Q8CAF4 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Nhsl1Q8CAF4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Nhsl1Q8CAF4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Nhsl1Q8CAF4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Nhsl1Q8CAF4 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Nhsl1Q8CAF4 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Nhsl1Q8CAF4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Nhsl1Q8CAF4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Nhsl1Q8CAF4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nhsl1Q8CAF4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nhsl1Q8CAF4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nhsl1Q8CAF4 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nhsl1Q8CAF4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nhsl1Q8CAF4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Nhsl1Q8CAF4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nhsl1Q8CAF4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nhsl1Q8CAF4 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nhsl1Q8CAF4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nhsl1Q8CAF4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nhsl1Q8CAF4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nhsl1Q8CAF4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nhsl1Q8CAF4 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nhsl1Q8CAF4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nhsl1Q8CAF4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nhsl1Q8CAF4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nhsl1Q8CAF4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nhsl1Q8CAF4 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nhsl1Q8CAF4 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Nhsl1Q8CAF4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nhsl1Q8CAF4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nhsl1Q8CAF4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nhsl1Q8CAF4 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nhsl1Q8CAF4 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nhsl1Q8CAF4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nhsl1Q8CAF4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nhsl1Q8CAF4 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nhsl1Q8CAF4 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nhsl1Q8CAF4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nhsl1Q8CAF4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Nhsl1Q8CAF4 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nhsl1Q8CAF4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nhsl1Q8CAF4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nhsl1Q8CAF4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nhsl1Q8CAF4 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nhsl1Q8CAF4 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nhsl1Q8CAF4 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Nhsl1Q8CAF4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nhsl1Q8CAF4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Nhsl1Q8CAF4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Nhsl1Q8CAF4 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Nhsl1Q8CAF4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Nhsl1Q8CAF4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nhsl1Q8CAF4 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nhsl1Q8CAF4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nhsl1Q8CAF4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nhsl1Q8CAF4 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nhsl1Q8CAF4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nhsl1Q8CAF4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nhsl1Q8CAF4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nhsl1Q8CAF4 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nhsl1Q8CAF4 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nhsl1Q8CAF4 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nhsl1Q8CAF4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Nhsl1Q8CAF4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nhsl1Q8CAF4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Nhsl1Q8CAF4 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nhsl1Q8CAF4 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nhsl1Q8CAF4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nhsl1Q8CAF4 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nhsl1Q8CAF4 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Nhsl1Q8CAF4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nhsl1Q8CAF4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nhsl1Q8CAF4 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nhsl1Q8CAF4 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nhsl1Q8CAF4 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nhsl1Q8CAF4 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nhsl1Q8CAF4 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nhsl1Q8CAF4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nhsl1Q8CAF4 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nhsl1Q8CAF4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Nhsl1Q8CAF4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nhsl1Q8CAF4 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nhsl1Q8CAF4 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nhsl1Q8CAF4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nhsl1Q8CAF4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nhsl1Q8CAF4 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Nhsl1Q8CAF4 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nhsl1Q8CAF4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nhsl1Q8CAF4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nhsl1Q8CAF4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
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