Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8T8

Tsr2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr2Q8C8T8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Tsr2Q8C8T8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tsr2Q8C8T8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tsr2Q8C8T8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tsr2Q8C8T8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tsr2Q8C8T8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tsr2Q8C8T8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tsr2Q8C8T8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tsr2Q8C8T8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tsr2Q8C8T8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tsr2Q8C8T8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tsr2Q8C8T8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tsr2Q8C8T8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tsr2Q8C8T8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tsr2Q8C8T8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tsr2Q8C8T8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tsr2Q8C8T8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tsr2Q8C8T8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tsr2Q8C8T8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tsr2Q8C8T8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tsr2Q8C8T8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tsr2Q8C8T8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tsr2Q8C8T8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tsr2Q8C8T8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tsr2Q8C8T8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tsr2Q8C8T8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tsr2Q8C8T8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tsr2Q8C8T8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tsr2Q8C8T8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tsr2Q8C8T8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tsr2Q8C8T8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tsr2Q8C8T8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tsr2Q8C8T8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tsr2Q8C8T8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tsr2Q8C8T8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tsr2Q8C8T8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tsr2Q8C8T8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tsr2Q8C8T8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Tsr2Q8C8T8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tsr2Q8C8T8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tsr2Q8C8T8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tsr2Q8C8T8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tsr2Q8C8T8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tsr2Q8C8T8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Tsr2Q8C8T8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tsr2Q8C8T8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tsr2Q8C8T8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tsr2Q8C8T8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tsr2Q8C8T8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tsr2Q8C8T8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tsr2Q8C8T8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tsr2Q8C8T8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tsr2Q8C8T8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tsr2Q8C8T8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tsr2Q8C8T8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tsr2Q8C8T8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tsr2Q8C8T8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tsr2Q8C8T8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tsr2Q8C8T8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Tsr2Q8C8T8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tsr2Q8C8T8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tsr2Q8C8T8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tsr2Q8C8T8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tsr2Q8C8T8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tsr2Q8C8T8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tsr2Q8C8T8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tsr2Q8C8T8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tsr2Q8C8T8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tsr2Q8C8T8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tsr2Q8C8T8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tsr2Q8C8T8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tsr2Q8C8T8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tsr2Q8C8T8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tsr2Q8C8T8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tsr2Q8C8T8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tsr2Q8C8T8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tsr2Q8C8T8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tsr2Q8C8T8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tsr2Q8C8T8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tsr2Q8C8T8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tsr2Q8C8T8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tsr2Q8C8T8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tsr2Q8C8T8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tsr2Q8C8T8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tsr2Q8C8T8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tsr2Q8C8T8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tsr2Q8C8T8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tsr2Q8C8T8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tsr2Q8C8T8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tsr2Q8C8T8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tsr2Q8C8T8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tsr2Q8C8T8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tsr2Q8C8T8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tsr2Q8C8T8 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tsr2Q8C8T8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tsr2Q8C8T8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tsr2Q8C8T8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tsr2Q8C8T8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tsr2Q8C8T8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tsr2Q8C8T8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms