Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q4

Nek11, Serine/threonine-protein kinase Nek11, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek11Q8C0Q4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nek11Q8C0Q4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nek11Q8C0Q4 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nek11Q8C0Q4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nek11Q8C0Q4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nek11Q8C0Q4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nek11Q8C0Q4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nek11Q8C0Q4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nek11Q8C0Q4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nek11Q8C0Q4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nek11Q8C0Q4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nek11Q8C0Q4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nek11Q8C0Q4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nek11Q8C0Q4 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
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Nek11Q8C0Q4 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nek11Q8C0Q4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
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Nek11Q8C0Q4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nek11Q8C0Q4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nek11Q8C0Q4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nek11Q8C0Q4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nek11Q8C0Q4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nek11Q8C0Q4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
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Nek11Q8C0Q4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
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Nek11Q8C0Q4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Nek11Q8C0Q4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nek11Q8C0Q4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nek11Q8C0Q4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nek11Q8C0Q4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Nek11Q8C0Q4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nek11Q8C0Q4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nek11Q8C0Q4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nek11Q8C0Q4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nek11Q8C0Q4 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nek11Q8C0Q4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
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Nek11Q8C0Q4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nek11Q8C0Q4 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nek11Q8C0Q4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
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Nek11Q8C0Q4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nek11Q8C0Q4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nek11Q8C0Q4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nek11Q8C0Q4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
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Nek11Q8C0Q4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nek11Q8C0Q4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nek11Q8C0Q4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
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Nek11Q8C0Q4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Nek11Q8C0Q4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nek11Q8C0Q4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nek11Q8C0Q4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nek11Q8C0Q4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
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Nek11Q8C0Q4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
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Nek11Q8C0Q4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nek11Q8C0Q4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nek11Q8C0Q4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nek11Q8C0Q4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
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Nek11Q8C0Q4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
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Nek11Q8C0Q4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
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Nek11Q8C0Q4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nek11Q8C0Q4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nek11Q8C0Q4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
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Nek11Q8C0Q4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nek11Q8C0Q4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nek11Q8C0Q4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nek11Q8C0Q4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nek11Q8C0Q4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nek11Q8C0Q4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nek11Q8C0Q4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Nek11Q8C0Q4 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nek11Q8C0Q4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nek11Q8C0Q4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nek11Q8C0Q4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nek11Q8C0Q4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nek11Q8C0Q4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nek11Q8C0Q4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nek11Q8C0Q4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nek11Q8C0Q4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nek11Q8C0Q4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nek11Q8C0Q4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Nek11Q8C0Q4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nek11Q8C0Q4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nek11Q8C0Q4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nek11Q8C0Q4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
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