Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX32

Slx1b, Structure-specific endonuclease subunit SLX1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx1bQ8BX32 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slx1bQ8BX32 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slx1bQ8BX32 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slx1bQ8BX32 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slx1bQ8BX32 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slx1bQ8BX32 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slx1bQ8BX32 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Slx1bQ8BX32 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slx1bQ8BX32 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slx1bQ8BX32 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slx1bQ8BX32 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slx1bQ8BX32 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Slx1bQ8BX32 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slx1bQ8BX32 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Slx1bQ8BX32 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slx1bQ8BX32 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slx1bQ8BX32 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slx1bQ8BX32 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slx1bQ8BX32 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slx1bQ8BX32 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slx1bQ8BX32 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slx1bQ8BX32 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slx1bQ8BX32 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slx1bQ8BX32 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slx1bQ8BX32 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slx1bQ8BX32 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slx1bQ8BX32 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slx1bQ8BX32 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slx1bQ8BX32 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slx1bQ8BX32 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slx1bQ8BX32 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slx1bQ8BX32 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slx1bQ8BX32 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Slx1bQ8BX32 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Slx1bQ8BX32 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slx1bQ8BX32 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slx1bQ8BX32 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slx1bQ8BX32 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slx1bQ8BX32 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slx1bQ8BX32 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slx1bQ8BX32 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slx1bQ8BX32 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slx1bQ8BX32 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slx1bQ8BX32 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slx1bQ8BX32 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Slx1bQ8BX32 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slx1bQ8BX32 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Slx1bQ8BX32 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slx1bQ8BX32 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slx1bQ8BX32 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slx1bQ8BX32 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slx1bQ8BX32 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slx1bQ8BX32 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slx1bQ8BX32 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slx1bQ8BX32 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slx1bQ8BX32 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slx1bQ8BX32 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slx1bQ8BX32 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slx1bQ8BX32 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slx1bQ8BX32 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slx1bQ8BX32 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slx1bQ8BX32 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slx1bQ8BX32 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slx1bQ8BX32 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slx1bQ8BX32 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slx1bQ8BX32 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slx1bQ8BX32 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slx1bQ8BX32 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slx1bQ8BX32 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slx1bQ8BX32 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slx1bQ8BX32 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slx1bQ8BX32 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slx1bQ8BX32 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Slx1bQ8BX32 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slx1bQ8BX32 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slx1bQ8BX32 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slx1bQ8BX32 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slx1bQ8BX32 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slx1bQ8BX32 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slx1bQ8BX32 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slx1bQ8BX32 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slx1bQ8BX32 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Slx1bQ8BX32 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slx1bQ8BX32 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slx1bQ8BX32 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slx1bQ8BX32 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slx1bQ8BX32 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Slx1bQ8BX32 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slx1bQ8BX32 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slx1bQ8BX32 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slx1bQ8BX32 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slx1bQ8BX32 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Slx1bQ8BX32 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slx1bQ8BX32 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Slx1bQ8BX32 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slx1bQ8BX32 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slx1bQ8BX32 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slx1bQ8BX32 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slx1bQ8BX32 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slx1bQ8BX32 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms