Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rbbp5Q8BX09 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rbbp5Q8BX09 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rbbp5Q8BX09 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rbbp5Q8BX09 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rbbp5Q8BX09 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rbbp5Q8BX09 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Rbbp5Q8BX09 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rbbp5Q8BX09 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Rbbp5Q8BX09 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rbbp5Q8BX09 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rbbp5Q8BX09 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rbbp5Q8BX09 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rbbp5Q8BX09 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rbbp5Q8BX09 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rbbp5Q8BX09 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rbbp5Q8BX09 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rbbp5Q8BX09 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rbbp5Q8BX09 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rbbp5Q8BX09 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rbbp5Q8BX09 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rbbp5Q8BX09 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rbbp5Q8BX09 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rbbp5Q8BX09 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rbbp5Q8BX09 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rbbp5Q8BX09 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rbbp5Q8BX09 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Rbbp5Q8BX09 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rbbp5Q8BX09 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rbbp5Q8BX09 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rbbp5Q8BX09 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rbbp5Q8BX09 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rbbp5Q8BX09 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rbbp5Q8BX09 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rbbp5Q8BX09 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rbbp5Q8BX09 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rbbp5Q8BX09 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rbbp5Q8BX09 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Rbbp5Q8BX09 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Rbbp5Q8BX09 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rbbp5Q8BX09 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rbbp5Q8BX09 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rbbp5Q8BX09 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rbbp5Q8BX09 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rbbp5Q8BX09 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rbbp5Q8BX09 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rbbp5Q8BX09 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rbbp5Q8BX09 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rbbp5Q8BX09 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rbbp5Q8BX09 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rbbp5Q8BX09 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rbbp5Q8BX09 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rbbp5Q8BX09 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rbbp5Q8BX09 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rbbp5Q8BX09 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Rbbp5Q8BX09 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Rbbp5Q8BX09 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rbbp5Q8BX09 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rbbp5Q8BX09 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rbbp5Q8BX09 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rbbp5Q8BX09 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rbbp5Q8BX09 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rbbp5Q8BX09 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rbbp5Q8BX09 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rbbp5Q8BX09 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rbbp5Q8BX09 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rbbp5Q8BX09 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rbbp5Q8BX09 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rbbp5Q8BX09 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rbbp5Q8BX09 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rbbp5Q8BX09 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rbbp5Q8BX09 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rbbp5Q8BX09 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rbbp5Q8BX09 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rbbp5Q8BX09 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rbbp5Q8BX09 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rbbp5Q8BX09 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rbbp5Q8BX09 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rbbp5Q8BX09 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rbbp5Q8BX09 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rbbp5Q8BX09 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rbbp5Q8BX09 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rbbp5Q8BX09 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rbbp5Q8BX09 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rbbp5Q8BX09 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rbbp5Q8BX09 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rbbp5Q8BX09 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Rbbp5Q8BX09 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rbbp5Q8BX09 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rbbp5Q8BX09 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rbbp5Q8BX09 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rbbp5Q8BX09 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rbbp5Q8BX09 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rbbp5Q8BX09 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rbbp5Q8BX09 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rbbp5Q8BX09 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rbbp5Q8BX09 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rbbp5Q8BX09 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rbbp5Q8BX09 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rbbp5Q8BX09 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms