Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWW4

Larp4, La-related protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 719 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Larp4Q8BWW4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Larp4Q8BWW4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Larp4Q8BWW4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Larp4Q8BWW4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Larp4Q8BWW4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Larp4Q8BWW4 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Larp4Q8BWW4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Larp4Q8BWW4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Larp4Q8BWW4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Larp4Q8BWW4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Larp4Q8BWW4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Larp4Q8BWW4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Larp4Q8BWW4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Larp4Q8BWW4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Larp4Q8BWW4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Larp4Q8BWW4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Larp4Q8BWW4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Larp4Q8BWW4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Larp4Q8BWW4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Larp4Q8BWW4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Larp4Q8BWW4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Larp4Q8BWW4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Larp4Q8BWW4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Larp4Q8BWW4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Larp4Q8BWW4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Larp4Q8BWW4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Larp4Q8BWW4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Larp4Q8BWW4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Larp4Q8BWW4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Larp4Q8BWW4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Larp4Q8BWW4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Larp4Q8BWW4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Larp4Q8BWW4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Larp4Q8BWW4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Larp4Q8BWW4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Larp4Q8BWW4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Larp4Q8BWW4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Larp4Q8BWW4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Larp4Q8BWW4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Larp4Q8BWW4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Larp4Q8BWW4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Larp4Q8BWW4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Larp4Q8BWW4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Larp4Q8BWW4 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Larp4Q8BWW4 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Larp4Q8BWW4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Larp4Q8BWW4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Larp4Q8BWW4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Larp4Q8BWW4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Larp4Q8BWW4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Larp4Q8BWW4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Larp4Q8BWW4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Larp4Q8BWW4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Larp4Q8BWW4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Larp4Q8BWW4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Larp4Q8BWW4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Larp4Q8BWW4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Larp4Q8BWW4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Larp4Q8BWW4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Larp4Q8BWW4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Larp4Q8BWW4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Larp4Q8BWW4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Larp4Q8BWW4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Larp4Q8BWW4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Larp4Q8BWW4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Larp4Q8BWW4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Larp4Q8BWW4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Larp4Q8BWW4 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Larp4Q8BWW4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Larp4Q8BWW4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Larp4Q8BWW4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Larp4Q8BWW4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Larp4Q8BWW4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Larp4Q8BWW4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Larp4Q8BWW4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Larp4Q8BWW4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Larp4Q8BWW4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Larp4Q8BWW4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Larp4Q8BWW4 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Larp4Q8BWW4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Larp4Q8BWW4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Larp4Q8BWW4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Larp4Q8BWW4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Larp4Q8BWW4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Larp4Q8BWW4 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Larp4Q8BWW4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Larp4Q8BWW4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Larp4Q8BWW4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Larp4Q8BWW4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Larp4Q8BWW4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Larp4Q8BWW4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Larp4Q8BWW4 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Larp4Q8BWW4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Larp4Q8BWW4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Larp4Q8BWW4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Larp4Q8BWW4 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Larp4Q8BWW4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Larp4Q8BWW4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Larp4Q8BWW4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Larp4Q8BWW4 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms