Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTQ0

PcgF3, Polycomb group RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcgF3Q8BTQ0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PcgF3Q8BTQ0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PcgF3Q8BTQ0 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PcgF3Q8BTQ0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PcgF3Q8BTQ0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PcgF3Q8BTQ0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PcgF3Q8BTQ0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PcgF3Q8BTQ0 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PcgF3Q8BTQ0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PcgF3Q8BTQ0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PcgF3Q8BTQ0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PcgF3Q8BTQ0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PcgF3Q8BTQ0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PcgF3Q8BTQ0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PcgF3Q8BTQ0 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PcgF3Q8BTQ0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PcgF3Q8BTQ0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PcgF3Q8BTQ0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PcgF3Q8BTQ0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PcgF3Q8BTQ0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PcgF3Q8BTQ0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PcgF3Q8BTQ0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PcgF3Q8BTQ0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PcgF3Q8BTQ0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PcgF3Q8BTQ0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PcgF3Q8BTQ0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PcgF3Q8BTQ0 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PcgF3Q8BTQ0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PcgF3Q8BTQ0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PcgF3Q8BTQ0 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PcgF3Q8BTQ0 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PcgF3Q8BTQ0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PcgF3Q8BTQ0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PcgF3Q8BTQ0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PcgF3Q8BTQ0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PcgF3Q8BTQ0 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PcgF3Q8BTQ0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PcgF3Q8BTQ0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PcgF3Q8BTQ0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PcgF3Q8BTQ0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PcgF3Q8BTQ0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PcgF3Q8BTQ0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PcgF3Q8BTQ0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PcgF3Q8BTQ0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PcgF3Q8BTQ0 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PcgF3Q8BTQ0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PcgF3Q8BTQ0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PcgF3Q8BTQ0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PcgF3Q8BTQ0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PcgF3Q8BTQ0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PcgF3Q8BTQ0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PcgF3Q8BTQ0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PcgF3Q8BTQ0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PcgF3Q8BTQ0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PcgF3Q8BTQ0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PcgF3Q8BTQ0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PcgF3Q8BTQ0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PcgF3Q8BTQ0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PcgF3Q8BTQ0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PcgF3Q8BTQ0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PcgF3Q8BTQ0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PcgF3Q8BTQ0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PcgF3Q8BTQ0 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PcgF3Q8BTQ0 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PcgF3Q8BTQ0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PcgF3Q8BTQ0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PcgF3Q8BTQ0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PcgF3Q8BTQ0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PcgF3Q8BTQ0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PcgF3Q8BTQ0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PcgF3Q8BTQ0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PcgF3Q8BTQ0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PcgF3Q8BTQ0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PcgF3Q8BTQ0 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PcgF3Q8BTQ0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PcgF3Q8BTQ0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PcgF3Q8BTQ0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PcgF3Q8BTQ0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PcgF3Q8BTQ0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PcgF3Q8BTQ0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PcgF3Q8BTQ0 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PcgF3Q8BTQ0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PcgF3Q8BTQ0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PcgF3Q8BTQ0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PcgF3Q8BTQ0 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PcgF3Q8BTQ0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PcgF3Q8BTQ0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PcgF3Q8BTQ0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PcgF3Q8BTQ0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PcgF3Q8BTQ0 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PcgF3Q8BTQ0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PcgF3Q8BTQ0 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PcgF3Q8BTQ0 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PcgF3Q8BTQ0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PcgF3Q8BTQ0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PcgF3Q8BTQ0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PcgF3Q8BTQ0 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PcgF3Q8BTQ0 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PcgF3Q8BTQ0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PcgF3Q8BTQ0 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms