Protein–RNA interactions for Protein: Q8BNV1

Trmt2a, tRNA (uracil-5-)-methyltransferase homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt2aQ8BNV1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trmt2aQ8BNV1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trmt2aQ8BNV1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trmt2aQ8BNV1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trmt2aQ8BNV1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trmt2aQ8BNV1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trmt2aQ8BNV1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trmt2aQ8BNV1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trmt2aQ8BNV1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trmt2aQ8BNV1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trmt2aQ8BNV1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trmt2aQ8BNV1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trmt2aQ8BNV1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trmt2aQ8BNV1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trmt2aQ8BNV1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Trmt2aQ8BNV1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trmt2aQ8BNV1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trmt2aQ8BNV1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Trmt2aQ8BNV1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trmt2aQ8BNV1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Trmt2aQ8BNV1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trmt2aQ8BNV1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trmt2aQ8BNV1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trmt2aQ8BNV1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trmt2aQ8BNV1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trmt2aQ8BNV1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trmt2aQ8BNV1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trmt2aQ8BNV1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trmt2aQ8BNV1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trmt2aQ8BNV1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trmt2aQ8BNV1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trmt2aQ8BNV1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trmt2aQ8BNV1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trmt2aQ8BNV1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trmt2aQ8BNV1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trmt2aQ8BNV1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Trmt2aQ8BNV1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trmt2aQ8BNV1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trmt2aQ8BNV1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trmt2aQ8BNV1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trmt2aQ8BNV1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trmt2aQ8BNV1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trmt2aQ8BNV1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trmt2aQ8BNV1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trmt2aQ8BNV1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Trmt2aQ8BNV1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trmt2aQ8BNV1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trmt2aQ8BNV1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trmt2aQ8BNV1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trmt2aQ8BNV1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trmt2aQ8BNV1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trmt2aQ8BNV1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trmt2aQ8BNV1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trmt2aQ8BNV1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trmt2aQ8BNV1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trmt2aQ8BNV1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trmt2aQ8BNV1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Trmt2aQ8BNV1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trmt2aQ8BNV1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trmt2aQ8BNV1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trmt2aQ8BNV1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trmt2aQ8BNV1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trmt2aQ8BNV1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trmt2aQ8BNV1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trmt2aQ8BNV1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trmt2aQ8BNV1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trmt2aQ8BNV1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trmt2aQ8BNV1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trmt2aQ8BNV1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Trmt2aQ8BNV1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trmt2aQ8BNV1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trmt2aQ8BNV1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trmt2aQ8BNV1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trmt2aQ8BNV1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trmt2aQ8BNV1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trmt2aQ8BNV1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trmt2aQ8BNV1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Trmt2aQ8BNV1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trmt2aQ8BNV1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trmt2aQ8BNV1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trmt2aQ8BNV1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trmt2aQ8BNV1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trmt2aQ8BNV1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trmt2aQ8BNV1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trmt2aQ8BNV1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trmt2aQ8BNV1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Trmt2aQ8BNV1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trmt2aQ8BNV1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trmt2aQ8BNV1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trmt2aQ8BNV1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trmt2aQ8BNV1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trmt2aQ8BNV1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trmt2aQ8BNV1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trmt2aQ8BNV1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trmt2aQ8BNV1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trmt2aQ8BNV1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trmt2aQ8BNV1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trmt2aQ8BNV1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trmt2aQ8BNV1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trmt2aQ8BNV1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms