Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Rufy1Q8BIJ7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rufy1Q8BIJ7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rufy1Q8BIJ7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rufy1Q8BIJ7 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rufy1Q8BIJ7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rufy1Q8BIJ7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rufy1Q8BIJ7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rufy1Q8BIJ7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rufy1Q8BIJ7 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rufy1Q8BIJ7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rufy1Q8BIJ7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rufy1Q8BIJ7 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rufy1Q8BIJ7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rufy1Q8BIJ7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rufy1Q8BIJ7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rufy1Q8BIJ7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rufy1Q8BIJ7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rufy1Q8BIJ7 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rufy1Q8BIJ7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rufy1Q8BIJ7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rufy1Q8BIJ7 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rufy1Q8BIJ7 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rufy1Q8BIJ7 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rufy1Q8BIJ7 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rufy1Q8BIJ7 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rufy1Q8BIJ7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Rufy1Q8BIJ7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rufy1Q8BIJ7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rufy1Q8BIJ7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rufy1Q8BIJ7 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rufy1Q8BIJ7 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rufy1Q8BIJ7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rufy1Q8BIJ7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rufy1Q8BIJ7 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rufy1Q8BIJ7 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rufy1Q8BIJ7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rufy1Q8BIJ7 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rufy1Q8BIJ7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rufy1Q8BIJ7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rufy1Q8BIJ7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rufy1Q8BIJ7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rufy1Q8BIJ7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Rufy1Q8BIJ7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rufy1Q8BIJ7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rufy1Q8BIJ7 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rufy1Q8BIJ7 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rufy1Q8BIJ7 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rufy1Q8BIJ7 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rufy1Q8BIJ7 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rufy1Q8BIJ7 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rufy1Q8BIJ7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rufy1Q8BIJ7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rufy1Q8BIJ7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rufy1Q8BIJ7 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rufy1Q8BIJ7 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rufy1Q8BIJ7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rufy1Q8BIJ7 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rufy1Q8BIJ7 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rufy1Q8BIJ7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rufy1Q8BIJ7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rufy1Q8BIJ7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rufy1Q8BIJ7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rufy1Q8BIJ7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rufy1Q8BIJ7 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rufy1Q8BIJ7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rufy1Q8BIJ7 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rufy1Q8BIJ7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rufy1Q8BIJ7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rufy1Q8BIJ7 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rufy1Q8BIJ7 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Rufy1Q8BIJ7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rufy1Q8BIJ7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rufy1Q8BIJ7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rufy1Q8BIJ7 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rufy1Q8BIJ7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rufy1Q8BIJ7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rufy1Q8BIJ7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rufy1Q8BIJ7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Rufy1Q8BIJ7 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rufy1Q8BIJ7 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rufy1Q8BIJ7 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rufy1Q8BIJ7 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rufy1Q8BIJ7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rufy1Q8BIJ7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rufy1Q8BIJ7 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rufy1Q8BIJ7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rufy1Q8BIJ7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rufy1Q8BIJ7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rufy1Q8BIJ7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rufy1Q8BIJ7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rufy1Q8BIJ7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rufy1Q8BIJ7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rufy1Q8BIJ7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rufy1Q8BIJ7 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rufy1Q8BIJ7 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rufy1Q8BIJ7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rufy1Q8BIJ7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rufy1Q8BIJ7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rufy1Q8BIJ7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms