Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Htatsf1Q8BGC0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Htatsf1Q8BGC0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Htatsf1Q8BGC0 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Htatsf1Q8BGC0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Htatsf1Q8BGC0 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Htatsf1Q8BGC0 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Htatsf1Q8BGC0 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Htatsf1Q8BGC0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Htatsf1Q8BGC0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Htatsf1Q8BGC0 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Htatsf1Q8BGC0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Htatsf1Q8BGC0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Htatsf1Q8BGC0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Htatsf1Q8BGC0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Htatsf1Q8BGC0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Htatsf1Q8BGC0 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Htatsf1Q8BGC0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Htatsf1Q8BGC0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Htatsf1Q8BGC0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Htatsf1Q8BGC0 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Htatsf1Q8BGC0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Htatsf1Q8BGC0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Htatsf1Q8BGC0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Htatsf1Q8BGC0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Htatsf1Q8BGC0 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Htatsf1Q8BGC0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Htatsf1Q8BGC0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Htatsf1Q8BGC0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Htatsf1Q8BGC0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Htatsf1Q8BGC0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Htatsf1Q8BGC0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Htatsf1Q8BGC0 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Htatsf1Q8BGC0 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Htatsf1Q8BGC0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Htatsf1Q8BGC0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Htatsf1Q8BGC0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Htatsf1Q8BGC0 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Htatsf1Q8BGC0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Htatsf1Q8BGC0 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Htatsf1Q8BGC0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Htatsf1Q8BGC0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Htatsf1Q8BGC0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Htatsf1Q8BGC0 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Htatsf1Q8BGC0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Htatsf1Q8BGC0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Htatsf1Q8BGC0 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Htatsf1Q8BGC0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Htatsf1Q8BGC0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Htatsf1Q8BGC0 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Htatsf1Q8BGC0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Htatsf1Q8BGC0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Htatsf1Q8BGC0 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Htatsf1Q8BGC0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Htatsf1Q8BGC0 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Htatsf1Q8BGC0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Htatsf1Q8BGC0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Htatsf1Q8BGC0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Htatsf1Q8BGC0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Htatsf1Q8BGC0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Htatsf1Q8BGC0 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Htatsf1Q8BGC0 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Htatsf1Q8BGC0 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Htatsf1Q8BGC0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Htatsf1Q8BGC0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Htatsf1Q8BGC0 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Htatsf1Q8BGC0 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Htatsf1Q8BGC0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Htatsf1Q8BGC0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Htatsf1Q8BGC0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Htatsf1Q8BGC0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Htatsf1Q8BGC0 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Htatsf1Q8BGC0 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Htatsf1Q8BGC0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Htatsf1Q8BGC0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Htatsf1Q8BGC0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Htatsf1Q8BGC0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Htatsf1Q8BGC0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Htatsf1Q8BGC0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Htatsf1Q8BGC0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Htatsf1Q8BGC0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Htatsf1Q8BGC0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Htatsf1Q8BGC0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Htatsf1Q8BGC0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Htatsf1Q8BGC0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Htatsf1Q8BGC0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Htatsf1Q8BGC0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Htatsf1Q8BGC0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Htatsf1Q8BGC0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Htatsf1Q8BGC0 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Htatsf1Q8BGC0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Htatsf1Q8BGC0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Htatsf1Q8BGC0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Htatsf1Q8BGC0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Htatsf1Q8BGC0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Htatsf1Q8BGC0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Htatsf1Q8BGC0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Htatsf1Q8BGC0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Htatsf1Q8BGC0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Htatsf1Q8BGC0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms