Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG54

Sptlc3, Serine palmitoyltransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptlc3Q8BG54 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sptlc3Q8BG54 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sptlc3Q8BG54 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sptlc3Q8BG54 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sptlc3Q8BG54 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sptlc3Q8BG54 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sptlc3Q8BG54 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sptlc3Q8BG54 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sptlc3Q8BG54 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sptlc3Q8BG54 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Sptlc3Q8BG54 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sptlc3Q8BG54 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sptlc3Q8BG54 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sptlc3Q8BG54 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sptlc3Q8BG54 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Sptlc3Q8BG54 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sptlc3Q8BG54 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sptlc3Q8BG54 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sptlc3Q8BG54 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sptlc3Q8BG54 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sptlc3Q8BG54 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sptlc3Q8BG54 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sptlc3Q8BG54 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sptlc3Q8BG54 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sptlc3Q8BG54 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sptlc3Q8BG54 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sptlc3Q8BG54 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Sptlc3Q8BG54 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sptlc3Q8BG54 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sptlc3Q8BG54 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sptlc3Q8BG54 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sptlc3Q8BG54 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sptlc3Q8BG54 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sptlc3Q8BG54 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sptlc3Q8BG54 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sptlc3Q8BG54 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Sptlc3Q8BG54 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sptlc3Q8BG54 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sptlc3Q8BG54 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sptlc3Q8BG54 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sptlc3Q8BG54 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sptlc3Q8BG54 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sptlc3Q8BG54 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sptlc3Q8BG54 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sptlc3Q8BG54 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sptlc3Q8BG54 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sptlc3Q8BG54 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sptlc3Q8BG54 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sptlc3Q8BG54 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sptlc3Q8BG54 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sptlc3Q8BG54 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sptlc3Q8BG54 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sptlc3Q8BG54 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sptlc3Q8BG54 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sptlc3Q8BG54 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Sptlc3Q8BG54 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sptlc3Q8BG54 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sptlc3Q8BG54 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sptlc3Q8BG54 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sptlc3Q8BG54 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sptlc3Q8BG54 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sptlc3Q8BG54 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sptlc3Q8BG54 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sptlc3Q8BG54 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sptlc3Q8BG54 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sptlc3Q8BG54 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sptlc3Q8BG54 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sptlc3Q8BG54 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sptlc3Q8BG54 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sptlc3Q8BG54 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sptlc3Q8BG54 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sptlc3Q8BG54 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sptlc3Q8BG54 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sptlc3Q8BG54 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sptlc3Q8BG54 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sptlc3Q8BG54 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sptlc3Q8BG54 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sptlc3Q8BG54 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sptlc3Q8BG54 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sptlc3Q8BG54 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sptlc3Q8BG54 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sptlc3Q8BG54 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sptlc3Q8BG54 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Sptlc3Q8BG54 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sptlc3Q8BG54 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sptlc3Q8BG54 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sptlc3Q8BG54 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sptlc3Q8BG54 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sptlc3Q8BG54 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sptlc3Q8BG54 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sptlc3Q8BG54 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sptlc3Q8BG54 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sptlc3Q8BG54 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sptlc3Q8BG54 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sptlc3Q8BG54 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sptlc3Q8BG54 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sptlc3Q8BG54 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sptlc3Q8BG54 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sptlc3Q8BG54 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sptlc3Q8BG54 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms