Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG15

Ctdspl2, CTD small phosphatase-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdspl2Q8BG15 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctdspl2Q8BG15 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctdspl2Q8BG15 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctdspl2Q8BG15 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctdspl2Q8BG15 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctdspl2Q8BG15 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctdspl2Q8BG15 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctdspl2Q8BG15 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctdspl2Q8BG15 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctdspl2Q8BG15 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctdspl2Q8BG15 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctdspl2Q8BG15 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctdspl2Q8BG15 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctdspl2Q8BG15 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctdspl2Q8BG15 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctdspl2Q8BG15 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctdspl2Q8BG15 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctdspl2Q8BG15 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ctdspl2Q8BG15 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ctdspl2Q8BG15 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ctdspl2Q8BG15 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ctdspl2Q8BG15 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ctdspl2Q8BG15 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctdspl2Q8BG15 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctdspl2Q8BG15 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctdspl2Q8BG15 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctdspl2Q8BG15 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctdspl2Q8BG15 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctdspl2Q8BG15 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctdspl2Q8BG15 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctdspl2Q8BG15 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctdspl2Q8BG15 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctdspl2Q8BG15 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctdspl2Q8BG15 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctdspl2Q8BG15 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctdspl2Q8BG15 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctdspl2Q8BG15 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctdspl2Q8BG15 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctdspl2Q8BG15 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctdspl2Q8BG15 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctdspl2Q8BG15 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctdspl2Q8BG15 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctdspl2Q8BG15 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctdspl2Q8BG15 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctdspl2Q8BG15 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctdspl2Q8BG15 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctdspl2Q8BG15 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctdspl2Q8BG15 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctdspl2Q8BG15 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctdspl2Q8BG15 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctdspl2Q8BG15 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctdspl2Q8BG15 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctdspl2Q8BG15 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctdspl2Q8BG15 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctdspl2Q8BG15 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctdspl2Q8BG15 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctdspl2Q8BG15 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctdspl2Q8BG15 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctdspl2Q8BG15 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctdspl2Q8BG15 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctdspl2Q8BG15 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctdspl2Q8BG15 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctdspl2Q8BG15 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctdspl2Q8BG15 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctdspl2Q8BG15 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctdspl2Q8BG15 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctdspl2Q8BG15 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctdspl2Q8BG15 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctdspl2Q8BG15 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctdspl2Q8BG15 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctdspl2Q8BG15 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctdspl2Q8BG15 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctdspl2Q8BG15 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctdspl2Q8BG15 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctdspl2Q8BG15 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctdspl2Q8BG15 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctdspl2Q8BG15 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctdspl2Q8BG15 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctdspl2Q8BG15 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctdspl2Q8BG15 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctdspl2Q8BG15 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctdspl2Q8BG15 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctdspl2Q8BG15 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctdspl2Q8BG15 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctdspl2Q8BG15 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctdspl2Q8BG15 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctdspl2Q8BG15 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctdspl2Q8BG15 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctdspl2Q8BG15 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctdspl2Q8BG15 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctdspl2Q8BG15 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctdspl2Q8BG15 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctdspl2Q8BG15 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctdspl2Q8BG15 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctdspl2Q8BG15 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctdspl2Q8BG15 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctdspl2Q8BG15 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctdspl2Q8BG15 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctdspl2Q8BG15 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctdspl2Q8BG15 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms