Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW7

H2-M10.5, Histocompatibility 2, M region locus 10.5, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.5Q85ZW7 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-M10.5Q85ZW7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-M10.5Q85ZW7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-M10.5Q85ZW7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-M10.5Q85ZW7 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-M10.5Q85ZW7 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-M10.5Q85ZW7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-M10.5Q85ZW7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-M10.5Q85ZW7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-M10.5Q85ZW7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-M10.5Q85ZW7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-M10.5Q85ZW7 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-M10.5Q85ZW7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-M10.5Q85ZW7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-M10.5Q85ZW7 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-M10.5Q85ZW7 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-M10.5Q85ZW7 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-M10.5Q85ZW7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-M10.5Q85ZW7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-M10.5Q85ZW7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-M10.5Q85ZW7 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-M10.5Q85ZW7 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-M10.5Q85ZW7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-M10.5Q85ZW7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-M10.5Q85ZW7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-M10.5Q85ZW7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-M10.5Q85ZW7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-M10.5Q85ZW7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-M10.5Q85ZW7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-M10.5Q85ZW7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-M10.5Q85ZW7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-M10.5Q85ZW7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-M10.5Q85ZW7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-M10.5Q85ZW7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-M10.5Q85ZW7 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-M10.5Q85ZW7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-M10.5Q85ZW7 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-M10.5Q85ZW7 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-M10.5Q85ZW7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-M10.5Q85ZW7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-M10.5Q85ZW7 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-M10.5Q85ZW7 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-M10.5Q85ZW7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-M10.5Q85ZW7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-M10.5Q85ZW7 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-M10.5Q85ZW7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-M10.5Q85ZW7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-M10.5Q85ZW7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-M10.5Q85ZW7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms