Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc50Q810U5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc50Q810U5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc50Q810U5 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc50Q810U5 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc50Q810U5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc50Q810U5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc50Q810U5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc50Q810U5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc50Q810U5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc50Q810U5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc50Q810U5 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc50Q810U5 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc50Q810U5 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc50Q810U5 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc50Q810U5 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc50Q810U5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc50Q810U5 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc50Q810U5 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc50Q810U5 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
Ccdc50Q810U5 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ccdc50Q810U5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc50Q810U5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc50Q810U5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc50Q810U5 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc50Q810U5 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc50Q810U5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc50Q810U5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc50Q810U5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc50Q810U5 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc50Q810U5 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc50Q810U5 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc50Q810U5 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc50Q810U5 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc50Q810U5 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc50Q810U5 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc50Q810U5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc50Q810U5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc50Q810U5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc50Q810U5 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc50Q810U5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc50Q810U5 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc50Q810U5 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc50Q810U5 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc50Q810U5 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc50Q810U5 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc50Q810U5 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc50Q810U5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc50Q810U5 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc50Q810U5 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc50Q810U5 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc50Q810U5 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc50Q810U5 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc50Q810U5 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc50Q810U5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc50Q810U5 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc50Q810U5 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc50Q810U5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc50Q810U5 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc50Q810U5 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc50Q810U5 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc50Q810U5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc50Q810U5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc50Q810U5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc50Q810U5 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc50Q810U5 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc50Q810U5 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc50Q810U5 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc50Q810U5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc50Q810U5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc50Q810U5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc50Q810U5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc50Q810U5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc50Q810U5 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc50Q810U5 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc50Q810U5 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc50Q810U5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc50Q810U5 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc50Q810U5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc50Q810U5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc50Q810U5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc50Q810U5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc50Q810U5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc50Q810U5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc50Q810U5 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc50Q810U5 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc50Q810U5 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc50Q810U5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc50Q810U5 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc50Q810U5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc50Q810U5 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc50Q810U5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc50Q810U5 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc50Q810U5 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc50Q810U5 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc50Q810U5 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc50Q810U5 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc50Q810U5 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc50Q810U5 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc50Q810U5 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms