Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc172Q810N9 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc172Q810N9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc172Q810N9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc172Q810N9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc172Q810N9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc172Q810N9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc172Q810N9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc172Q810N9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc172Q810N9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc172Q810N9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc172Q810N9 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc172Q810N9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc172Q810N9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc172Q810N9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc172Q810N9 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc172Q810N9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc172Q810N9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc172Q810N9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc172Q810N9 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc172Q810N9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc172Q810N9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc172Q810N9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc172Q810N9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc172Q810N9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc172Q810N9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc172Q810N9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc172Q810N9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc172Q810N9 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc172Q810N9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc172Q810N9 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc172Q810N9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc172Q810N9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc172Q810N9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc172Q810N9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc172Q810N9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc172Q810N9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc172Q810N9 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc172Q810N9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc172Q810N9 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc172Q810N9 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc172Q810N9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc172Q810N9 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc172Q810N9 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc172Q810N9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc172Q810N9 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc172Q810N9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc172Q810N9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc172Q810N9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc172Q810N9 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc172Q810N9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc172Q810N9 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc172Q810N9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc172Q810N9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc172Q810N9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc172Q810N9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc172Q810N9 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc172Q810N9 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc172Q810N9 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc172Q810N9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc172Q810N9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc172Q810N9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc172Q810N9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc172Q810N9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc172Q810N9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc172Q810N9 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc172Q810N9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc172Q810N9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc172Q810N9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc172Q810N9 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc172Q810N9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc172Q810N9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc172Q810N9 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc172Q810N9 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc172Q810N9 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc172Q810N9 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc172Q810N9 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc172Q810N9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc172Q810N9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc172Q810N9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc172Q810N9 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc172Q810N9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc172Q810N9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc172Q810N9 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc172Q810N9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc172Q810N9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc172Q810N9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc172Q810N9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc172Q810N9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc172Q810N9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc172Q810N9 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc172Q810N9 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc172Q810N9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc172Q810N9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc172Q810N9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc172Q810N9 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc172Q810N9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc172Q810N9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc172Q810N9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc172Q810N9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms